Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3S3

Snx29, Sorting nexin-29, mousemouse

Predictions only

Length 818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx29Q9D3S3 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Snx29Q9D3S3 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Snx29Q9D3S3 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Snx29Q9D3S3 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Snx29Q9D3S3 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Snx29Q9D3S3 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Snx29Q9D3S3 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Snx29Q9D3S3 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Snx29Q9D3S3 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Snx29Q9D3S3 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Snx29Q9D3S3 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Snx29Q9D3S3 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Snx29Q9D3S3 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Snx29Q9D3S3 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Snx29Q9D3S3 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Snx29Q9D3S3 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Snx29Q9D3S3 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Snx29Q9D3S3 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Snx29Q9D3S3 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Snx29Q9D3S3 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Snx29Q9D3S3 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Snx29Q9D3S3 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Snx29Q9D3S3 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Snx29Q9D3S3 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Snx29Q9D3S3 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Snx29Q9D3S3 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Snx29Q9D3S3 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Snx29Q9D3S3 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Snx29Q9D3S3 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Snx29Q9D3S3 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Snx29Q9D3S3 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Snx29Q9D3S3 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Snx29Q9D3S3 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Snx29Q9D3S3 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Snx29Q9D3S3 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Snx29Q9D3S3 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Snx29Q9D3S3 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Snx29Q9D3S3 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Snx29Q9D3S3 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Snx29Q9D3S3 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Snx29Q9D3S3 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Snx29Q9D3S3 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Snx29Q9D3S3 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Snx29Q9D3S3 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Snx29Q9D3S3 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Snx29Q9D3S3 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Snx29Q9D3S3 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Snx29Q9D3S3 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Snx29Q9D3S3 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Snx29Q9D3S3 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Snx29Q9D3S3 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Snx29Q9D3S3 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Snx29Q9D3S3 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Snx29Q9D3S3 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Snx29Q9D3S3 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Snx29Q9D3S3 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Snx29Q9D3S3 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Snx29Q9D3S3 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Snx29Q9D3S3 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Snx29Q9D3S3 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Snx29Q9D3S3 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Snx29Q9D3S3 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Snx29Q9D3S3 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Snx29Q9D3S3 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Snx29Q9D3S3 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Snx29Q9D3S3 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Snx29Q9D3S3 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Snx29Q9D3S3 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Snx29Q9D3S3 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Snx29Q9D3S3 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Snx29Q9D3S3 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Snx29Q9D3S3 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Snx29Q9D3S3 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Snx29Q9D3S3 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Snx29Q9D3S3 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Snx29Q9D3S3 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Snx29Q9D3S3 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Snx29Q9D3S3 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Snx29Q9D3S3 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Snx29Q9D3S3 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Snx29Q9D3S3 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Snx29Q9D3S3 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Snx29Q9D3S3 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Snx29Q9D3S3 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Snx29Q9D3S3 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Snx29Q9D3S3 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Snx29Q9D3S3 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Snx29Q9D3S3 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Snx29Q9D3S3 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Snx29Q9D3S3 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Snx29Q9D3S3 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Snx29Q9D3S3 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Snx29Q9D3S3 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Snx29Q9D3S3 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Snx29Q9D3S3 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Snx29Q9D3S3 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Snx29Q9D3S3 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Snx29Q9D3S3 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Snx29Q9D3S3 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Snx29Q9D3S3 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms