Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3G5

Stx11, Syntaxin-11, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx11Q9D3G5 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Stx11Q9D3G5 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Stx11Q9D3G5 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Stx11Q9D3G5 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Stx11Q9D3G5 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Stx11Q9D3G5 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Stx11Q9D3G5 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Stx11Q9D3G5 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Stx11Q9D3G5 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Stx11Q9D3G5 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Stx11Q9D3G5 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Stx11Q9D3G5 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Stx11Q9D3G5 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Stx11Q9D3G5 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Stx11Q9D3G5 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Stx11Q9D3G5 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Stx11Q9D3G5 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Stx11Q9D3G5 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Stx11Q9D3G5 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Stx11Q9D3G5 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Stx11Q9D3G5 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Stx11Q9D3G5 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Stx11Q9D3G5 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Stx11Q9D3G5 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Stx11Q9D3G5 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Stx11Q9D3G5 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Stx11Q9D3G5 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Stx11Q9D3G5 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Stx11Q9D3G5 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Stx11Q9D3G5 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Stx11Q9D3G5 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Stx11Q9D3G5 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Stx11Q9D3G5 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Stx11Q9D3G5 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Stx11Q9D3G5 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Stx11Q9D3G5 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Stx11Q9D3G5 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Stx11Q9D3G5 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Stx11Q9D3G5 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Stx11Q9D3G5 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Stx11Q9D3G5 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Stx11Q9D3G5 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Stx11Q9D3G5 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Stx11Q9D3G5 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Stx11Q9D3G5 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Stx11Q9D3G5 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Stx11Q9D3G5 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Stx11Q9D3G5 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Stx11Q9D3G5 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Stx11Q9D3G5 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Stx11Q9D3G5 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Stx11Q9D3G5 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Stx11Q9D3G5 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Stx11Q9D3G5 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Stx11Q9D3G5 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Stx11Q9D3G5 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Stx11Q9D3G5 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Stx11Q9D3G5 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Stx11Q9D3G5 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stx11Q9D3G5 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stx11Q9D3G5 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stx11Q9D3G5 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stx11Q9D3G5 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stx11Q9D3G5 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stx11Q9D3G5 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stx11Q9D3G5 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stx11Q9D3G5 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Stx11Q9D3G5 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stx11Q9D3G5 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stx11Q9D3G5 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stx11Q9D3G5 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Stx11Q9D3G5 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Stx11Q9D3G5 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stx11Q9D3G5 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stx11Q9D3G5 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stx11Q9D3G5 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stx11Q9D3G5 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stx11Q9D3G5 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stx11Q9D3G5 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stx11Q9D3G5 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stx11Q9D3G5 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stx11Q9D3G5 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stx11Q9D3G5 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stx11Q9D3G5 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stx11Q9D3G5 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stx11Q9D3G5 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Stx11Q9D3G5 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stx11Q9D3G5 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stx11Q9D3G5 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stx11Q9D3G5 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stx11Q9D3G5 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stx11Q9D3G5 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stx11Q9D3G5 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stx11Q9D3G5 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stx11Q9D3G5 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stx11Q9D3G5 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stx11Q9D3G5 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stx11Q9D3G5 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stx11Q9D3G5 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stx11Q9D3G5 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.1 ms