Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2P4

Urm1, Ubiquitin-related modifier 1, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Urm1Q9D2P4 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Urm1Q9D2P4 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Urm1Q9D2P4 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Urm1Q9D2P4 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Urm1Q9D2P4 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Urm1Q9D2P4 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Urm1Q9D2P4 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Urm1Q9D2P4 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Urm1Q9D2P4 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Urm1Q9D2P4 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Urm1Q9D2P4 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Urm1Q9D2P4 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Urm1Q9D2P4 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Urm1Q9D2P4 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Urm1Q9D2P4 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Urm1Q9D2P4 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Urm1Q9D2P4 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Urm1Q9D2P4 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Urm1Q9D2P4 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Urm1Q9D2P4 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Urm1Q9D2P4 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Urm1Q9D2P4 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Urm1Q9D2P4 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Urm1Q9D2P4 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Urm1Q9D2P4 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Urm1Q9D2P4 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Urm1Q9D2P4 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Urm1Q9D2P4 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Urm1Q9D2P4 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Urm1Q9D2P4 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Urm1Q9D2P4 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Urm1Q9D2P4 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Urm1Q9D2P4 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Urm1Q9D2P4 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Urm1Q9D2P4 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Urm1Q9D2P4 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Urm1Q9D2P4 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Urm1Q9D2P4 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Urm1Q9D2P4 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Urm1Q9D2P4 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Urm1Q9D2P4 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Urm1Q9D2P4 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Urm1Q9D2P4 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Urm1Q9D2P4 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Urm1Q9D2P4 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Urm1Q9D2P4 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Urm1Q9D2P4 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Urm1Q9D2P4 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Urm1Q9D2P4 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Urm1Q9D2P4 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Urm1Q9D2P4 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Urm1Q9D2P4 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Urm1Q9D2P4 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Urm1Q9D2P4 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Urm1Q9D2P4 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Urm1Q9D2P4 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Urm1Q9D2P4 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Urm1Q9D2P4 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Urm1Q9D2P4 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Urm1Q9D2P4 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Urm1Q9D2P4 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Urm1Q9D2P4 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Urm1Q9D2P4 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Urm1Q9D2P4 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Urm1Q9D2P4 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Urm1Q9D2P4 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Urm1Q9D2P4 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Urm1Q9D2P4 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Urm1Q9D2P4 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Urm1Q9D2P4 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Urm1Q9D2P4 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Urm1Q9D2P4 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Urm1Q9D2P4 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Urm1Q9D2P4 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Urm1Q9D2P4 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Urm1Q9D2P4 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Urm1Q9D2P4 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Urm1Q9D2P4 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Urm1Q9D2P4 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Urm1Q9D2P4 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Urm1Q9D2P4 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Urm1Q9D2P4 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Urm1Q9D2P4 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Urm1Q9D2P4 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Urm1Q9D2P4 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Urm1Q9D2P4 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Urm1Q9D2P4 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Urm1Q9D2P4 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Urm1Q9D2P4 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Urm1Q9D2P4 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Urm1Q9D2P4 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Urm1Q9D2P4 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Urm1Q9D2P4 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Urm1Q9D2P4 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Urm1Q9D2P4 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Urm1Q9D2P4 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Urm1Q9D2P4 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Urm1Q9D2P4 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Urm1Q9D2P4 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Urm1Q9D2P4 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms