Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1F3

Uncharacterized protein CXorf40 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D1F3 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q9D1F3 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q9D1F3 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q9D1F3 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q9D1F3 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q9D1F3 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q9D1F3 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q9D1F3 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q9D1F3 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q9D1F3 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q9D1F3 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Q9D1F3 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q9D1F3 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q9D1F3 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q9D1F3 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q9D1F3 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q9D1F3 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q9D1F3 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q9D1F3 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q9D1F3 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q9D1F3 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q9D1F3 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q9D1F3 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q9D1F3 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q9D1F3 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q9D1F3 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q9D1F3 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q9D1F3 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q9D1F3 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Q9D1F3 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q9D1F3 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q9D1F3 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q9D1F3 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q9D1F3 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q9D1F3 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q9D1F3 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q9D1F3 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q9D1F3 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q9D1F3 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q9D1F3 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q9D1F3 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q9D1F3 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q9D1F3 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q9D1F3 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q9D1F3 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q9D1F3 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q9D1F3 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q9D1F3 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q9D1F3 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q9D1F3 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q9D1F3 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q9D1F3 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q9D1F3 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q9D1F3 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q9D1F3 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q9D1F3 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q9D1F3 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Q9D1F3 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q9D1F3 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q9D1F3 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q9D1F3 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q9D1F3 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q9D1F3 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q9D1F3 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q9D1F3 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q9D1F3 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q9D1F3 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q9D1F3 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q9D1F3 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q9D1F3 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q9D1F3 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q9D1F3 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Q9D1F3 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q9D1F3 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q9D1F3 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q9D1F3 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q9D1F3 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q9D1F3 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q9D1F3 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q9D1F3 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q9D1F3 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Q9D1F3 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Q9D1F3 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Q9D1F3 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Q9D1F3 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Q9D1F3 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Q9D1F3 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Q9D1F3 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Q9D1F3 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Q9D1F3 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Q9D1F3 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Q9D1F3 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Q9D1F3 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Q9D1F3 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Q9D1F3 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Q9D1F3 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Q9D1F3 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Q9D1F3 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Q9D1F3 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q9D1F3 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms