Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1E5

Lmbr1l, Protein LMBR1L, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1lQ9D1E5 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lmbr1lQ9D1E5 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lmbr1lQ9D1E5 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lmbr1lQ9D1E5 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lmbr1lQ9D1E5 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lmbr1lQ9D1E5 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Lmbr1lQ9D1E5 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lmbr1lQ9D1E5 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lmbr1lQ9D1E5 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lmbr1lQ9D1E5 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lmbr1lQ9D1E5 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lmbr1lQ9D1E5 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lmbr1lQ9D1E5 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Lmbr1lQ9D1E5 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Lmbr1lQ9D1E5 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Lmbr1lQ9D1E5 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lmbr1lQ9D1E5 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lmbr1lQ9D1E5 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lmbr1lQ9D1E5 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lmbr1lQ9D1E5 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lmbr1lQ9D1E5 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lmbr1lQ9D1E5 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lmbr1lQ9D1E5 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lmbr1lQ9D1E5 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lmbr1lQ9D1E5 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lmbr1lQ9D1E5 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Lmbr1lQ9D1E5 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lmbr1lQ9D1E5 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lmbr1lQ9D1E5 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lmbr1lQ9D1E5 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lmbr1lQ9D1E5 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lmbr1lQ9D1E5 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lmbr1lQ9D1E5 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lmbr1lQ9D1E5 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lmbr1lQ9D1E5 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lmbr1lQ9D1E5 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lmbr1lQ9D1E5 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lmbr1lQ9D1E5 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lmbr1lQ9D1E5 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lmbr1lQ9D1E5 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lmbr1lQ9D1E5 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lmbr1lQ9D1E5 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lmbr1lQ9D1E5 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lmbr1lQ9D1E5 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lmbr1lQ9D1E5 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lmbr1lQ9D1E5 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lmbr1lQ9D1E5 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lmbr1lQ9D1E5 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lmbr1lQ9D1E5 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lmbr1lQ9D1E5 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lmbr1lQ9D1E5 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lmbr1lQ9D1E5 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lmbr1lQ9D1E5 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lmbr1lQ9D1E5 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lmbr1lQ9D1E5 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lmbr1lQ9D1E5 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lmbr1lQ9D1E5 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lmbr1lQ9D1E5 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lmbr1lQ9D1E5 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Lmbr1lQ9D1E5 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lmbr1lQ9D1E5 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lmbr1lQ9D1E5 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lmbr1lQ9D1E5 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lmbr1lQ9D1E5 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Lmbr1lQ9D1E5 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lmbr1lQ9D1E5 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Lmbr1lQ9D1E5 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Lmbr1lQ9D1E5 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Lmbr1lQ9D1E5 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Lmbr1lQ9D1E5 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Lmbr1lQ9D1E5 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Lmbr1lQ9D1E5 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Lmbr1lQ9D1E5 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Lmbr1lQ9D1E5 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Lmbr1lQ9D1E5 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Lmbr1lQ9D1E5 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Lmbr1lQ9D1E5 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Lmbr1lQ9D1E5 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Lmbr1lQ9D1E5 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Lmbr1lQ9D1E5 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Lmbr1lQ9D1E5 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Lmbr1lQ9D1E5 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Lmbr1lQ9D1E5 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Lmbr1lQ9D1E5 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC21.02■□□□□ 0.95
Lmbr1lQ9D1E5 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lmbr1lQ9D1E5 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lmbr1lQ9D1E5 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lmbr1lQ9D1E5 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lmbr1lQ9D1E5 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Lmbr1lQ9D1E5 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lmbr1lQ9D1E5 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lmbr1lQ9D1E5 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lmbr1lQ9D1E5 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lmbr1lQ9D1E5 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lmbr1lQ9D1E5 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lmbr1lQ9D1E5 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lmbr1lQ9D1E5 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lmbr1lQ9D1E5 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lmbr1lQ9D1E5 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lmbr1lQ9D1E5 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 217.6 ms