Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1C1

Ube2c, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 C, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2cQ9D1C1 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ube2cQ9D1C1 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ube2cQ9D1C1 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ube2cQ9D1C1 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ube2cQ9D1C1 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ube2cQ9D1C1 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ube2cQ9D1C1 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ube2cQ9D1C1 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ube2cQ9D1C1 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ube2cQ9D1C1 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ube2cQ9D1C1 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ube2cQ9D1C1 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ube2cQ9D1C1 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ube2cQ9D1C1 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ube2cQ9D1C1 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ube2cQ9D1C1 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ube2cQ9D1C1 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ube2cQ9D1C1 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ube2cQ9D1C1 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ube2cQ9D1C1 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ube2cQ9D1C1 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ube2cQ9D1C1 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ube2cQ9D1C1 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ube2cQ9D1C1 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ube2cQ9D1C1 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ube2cQ9D1C1 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ube2cQ9D1C1 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ube2cQ9D1C1 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ube2cQ9D1C1 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ube2cQ9D1C1 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ube2cQ9D1C1 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ube2cQ9D1C1 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ube2cQ9D1C1 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ube2cQ9D1C1 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ube2cQ9D1C1 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ube2cQ9D1C1 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ube2cQ9D1C1 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ube2cQ9D1C1 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ube2cQ9D1C1 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ube2cQ9D1C1 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ube2cQ9D1C1 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ube2cQ9D1C1 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ube2cQ9D1C1 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ube2cQ9D1C1 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ube2cQ9D1C1 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ube2cQ9D1C1 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ube2cQ9D1C1 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ube2cQ9D1C1 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ube2cQ9D1C1 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ube2cQ9D1C1 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ube2cQ9D1C1 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ube2cQ9D1C1 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ube2cQ9D1C1 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ube2cQ9D1C1 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ube2cQ9D1C1 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ube2cQ9D1C1 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ube2cQ9D1C1 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ube2cQ9D1C1 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ube2cQ9D1C1 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ube2cQ9D1C1 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ube2cQ9D1C1 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ube2cQ9D1C1 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ube2cQ9D1C1 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ube2cQ9D1C1 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ube2cQ9D1C1 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ube2cQ9D1C1 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ube2cQ9D1C1 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ube2cQ9D1C1 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ube2cQ9D1C1 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ube2cQ9D1C1 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ube2cQ9D1C1 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ube2cQ9D1C1 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ube2cQ9D1C1 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ube2cQ9D1C1 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ube2cQ9D1C1 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ube2cQ9D1C1 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ube2cQ9D1C1 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ube2cQ9D1C1 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ube2cQ9D1C1 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ube2cQ9D1C1 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ube2cQ9D1C1 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ube2cQ9D1C1 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ube2cQ9D1C1 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ube2cQ9D1C1 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ube2cQ9D1C1 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ube2cQ9D1C1 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ube2cQ9D1C1 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ube2cQ9D1C1 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ube2cQ9D1C1 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ube2cQ9D1C1 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ube2cQ9D1C1 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ube2cQ9D1C1 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ube2cQ9D1C1 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ube2cQ9D1C1 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ube2cQ9D1C1 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ube2cQ9D1C1 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ube2cQ9D1C1 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ube2cQ9D1C1 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ube2cQ9D1C1 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ube2cQ9D1C1 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms