Protein–RNA interactions for Protein: Q9D198

Syf2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syf2Q9D198 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Syf2Q9D198 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Syf2Q9D198 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Syf2Q9D198 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Syf2Q9D198 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Syf2Q9D198 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Syf2Q9D198 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Syf2Q9D198 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Syf2Q9D198 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Syf2Q9D198 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Syf2Q9D198 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Syf2Q9D198 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Syf2Q9D198 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Syf2Q9D198 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Syf2Q9D198 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Syf2Q9D198 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Syf2Q9D198 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Syf2Q9D198 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Syf2Q9D198 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Syf2Q9D198 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Syf2Q9D198 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Syf2Q9D198 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Syf2Q9D198 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Syf2Q9D198 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Syf2Q9D198 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Syf2Q9D198 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Syf2Q9D198 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Syf2Q9D198 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Syf2Q9D198 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Syf2Q9D198 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Syf2Q9D198 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Syf2Q9D198 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Syf2Q9D198 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Syf2Q9D198 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Syf2Q9D198 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Syf2Q9D198 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Syf2Q9D198 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Syf2Q9D198 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Syf2Q9D198 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Syf2Q9D198 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Syf2Q9D198 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Syf2Q9D198 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Syf2Q9D198 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Syf2Q9D198 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Syf2Q9D198 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Syf2Q9D198 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Syf2Q9D198 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Syf2Q9D198 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Syf2Q9D198 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Syf2Q9D198 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Syf2Q9D198 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Syf2Q9D198 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Syf2Q9D198 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Syf2Q9D198 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Syf2Q9D198 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Syf2Q9D198 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Syf2Q9D198 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Syf2Q9D198 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Syf2Q9D198 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Syf2Q9D198 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Syf2Q9D198 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Syf2Q9D198 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Syf2Q9D198 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Syf2Q9D198 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Syf2Q9D198 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Syf2Q9D198 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Syf2Q9D198 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Syf2Q9D198 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Syf2Q9D198 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Syf2Q9D198 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Syf2Q9D198 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Syf2Q9D198 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Syf2Q9D198 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Syf2Q9D198 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Syf2Q9D198 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Syf2Q9D198 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Syf2Q9D198 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Syf2Q9D198 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Syf2Q9D198 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Syf2Q9D198 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Syf2Q9D198 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Syf2Q9D198 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Syf2Q9D198 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Syf2Q9D198 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Syf2Q9D198 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Syf2Q9D198 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Syf2Q9D198 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Syf2Q9D198 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Syf2Q9D198 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Syf2Q9D198 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Syf2Q9D198 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Syf2Q9D198 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Syf2Q9D198 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Syf2Q9D198 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Syf2Q9D198 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Syf2Q9D198 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Syf2Q9D198 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Syf2Q9D198 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Syf2Q9D198 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Syf2Q9D198 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms