Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0T7

Gkn3, Gastrokine-3, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gkn3Q9D0T7 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gkn3Q9D0T7 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gkn3Q9D0T7 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gkn3Q9D0T7 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gkn3Q9D0T7 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gkn3Q9D0T7 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gkn3Q9D0T7 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gkn3Q9D0T7 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gkn3Q9D0T7 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gkn3Q9D0T7 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gkn3Q9D0T7 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gkn3Q9D0T7 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gkn3Q9D0T7 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gkn3Q9D0T7 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gkn3Q9D0T7 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gkn3Q9D0T7 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gkn3Q9D0T7 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gkn3Q9D0T7 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gkn3Q9D0T7 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gkn3Q9D0T7 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gkn3Q9D0T7 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gkn3Q9D0T7 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gkn3Q9D0T7 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gkn3Q9D0T7 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gkn3Q9D0T7 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gkn3Q9D0T7 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gkn3Q9D0T7 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gkn3Q9D0T7 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gkn3Q9D0T7 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gkn3Q9D0T7 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gkn3Q9D0T7 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gkn3Q9D0T7 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gkn3Q9D0T7 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gkn3Q9D0T7 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gkn3Q9D0T7 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gkn3Q9D0T7 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gkn3Q9D0T7 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gkn3Q9D0T7 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gkn3Q9D0T7 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gkn3Q9D0T7 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gkn3Q9D0T7 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gkn3Q9D0T7 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gkn3Q9D0T7 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gkn3Q9D0T7 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gkn3Q9D0T7 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gkn3Q9D0T7 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gkn3Q9D0T7 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gkn3Q9D0T7 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gkn3Q9D0T7 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gkn3Q9D0T7 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gkn3Q9D0T7 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gkn3Q9D0T7 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gkn3Q9D0T7 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gkn3Q9D0T7 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gkn3Q9D0T7 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gkn3Q9D0T7 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gkn3Q9D0T7 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gkn3Q9D0T7 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gkn3Q9D0T7 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gkn3Q9D0T7 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gkn3Q9D0T7 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gkn3Q9D0T7 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gkn3Q9D0T7 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gkn3Q9D0T7 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gkn3Q9D0T7 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gkn3Q9D0T7 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gkn3Q9D0T7 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gkn3Q9D0T7 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gkn3Q9D0T7 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gkn3Q9D0T7 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gkn3Q9D0T7 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gkn3Q9D0T7 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gkn3Q9D0T7 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gkn3Q9D0T7 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gkn3Q9D0T7 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gkn3Q9D0T7 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gkn3Q9D0T7 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gkn3Q9D0T7 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gkn3Q9D0T7 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gkn3Q9D0T7 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gkn3Q9D0T7 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gkn3Q9D0T7 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gkn3Q9D0T7 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gkn3Q9D0T7 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gkn3Q9D0T7 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gkn3Q9D0T7 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gkn3Q9D0T7 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gkn3Q9D0T7 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gkn3Q9D0T7 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gkn3Q9D0T7 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gkn3Q9D0T7 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gkn3Q9D0T7 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gkn3Q9D0T7 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gkn3Q9D0T7 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gkn3Q9D0T7 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gkn3Q9D0T7 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gkn3Q9D0T7 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gkn3Q9D0T7 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gkn3Q9D0T7 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gkn3Q9D0T7 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms