Protein–RNA interactions for Protein: Q9D030

Twist2, Twist-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Twist2Q9D030 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Twist2Q9D030 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Twist2Q9D030 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Twist2Q9D030 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Twist2Q9D030 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Twist2Q9D030 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Twist2Q9D030 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Twist2Q9D030 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Twist2Q9D030 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Twist2Q9D030 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Twist2Q9D030 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Twist2Q9D030 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Twist2Q9D030 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Twist2Q9D030 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Twist2Q9D030 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Twist2Q9D030 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Twist2Q9D030 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Twist2Q9D030 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Twist2Q9D030 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Twist2Q9D030 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Twist2Q9D030 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Twist2Q9D030 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Twist2Q9D030 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Twist2Q9D030 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Twist2Q9D030 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Twist2Q9D030 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Twist2Q9D030 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Twist2Q9D030 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Twist2Q9D030 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Twist2Q9D030 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Twist2Q9D030 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Twist2Q9D030 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Twist2Q9D030 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Twist2Q9D030 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Twist2Q9D030 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Twist2Q9D030 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Twist2Q9D030 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Twist2Q9D030 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Twist2Q9D030 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Twist2Q9D030 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Twist2Q9D030 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Twist2Q9D030 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Twist2Q9D030 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Twist2Q9D030 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Twist2Q9D030 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Twist2Q9D030 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Twist2Q9D030 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Twist2Q9D030 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Twist2Q9D030 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Twist2Q9D030 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Twist2Q9D030 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Twist2Q9D030 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Twist2Q9D030 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Twist2Q9D030 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Twist2Q9D030 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Twist2Q9D030 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Twist2Q9D030 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Twist2Q9D030 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Twist2Q9D030 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Twist2Q9D030 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Twist2Q9D030 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Twist2Q9D030 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Twist2Q9D030 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Twist2Q9D030 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Twist2Q9D030 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Twist2Q9D030 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Twist2Q9D030 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Twist2Q9D030 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Twist2Q9D030 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Twist2Q9D030 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Twist2Q9D030 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Twist2Q9D030 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Twist2Q9D030 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Twist2Q9D030 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Twist2Q9D030 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Twist2Q9D030 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Twist2Q9D030 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Twist2Q9D030 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Twist2Q9D030 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Twist2Q9D030 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Twist2Q9D030 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Twist2Q9D030 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Twist2Q9D030 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Twist2Q9D030 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Twist2Q9D030 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Twist2Q9D030 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Twist2Q9D030 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Twist2Q9D030 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Twist2Q9D030 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Twist2Q9D030 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Twist2Q9D030 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Twist2Q9D030 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Twist2Q9D030 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Twist2Q9D030 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Twist2Q9D030 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Twist2Q9D030 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Twist2Q9D030 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Twist2Q9D030 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Twist2Q9D030 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Twist2Q9D030 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms