Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZN4

Shisa9, Protein shisa-9, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisa9Q9CZN4 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Shisa9Q9CZN4 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Shisa9Q9CZN4 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Shisa9Q9CZN4 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Shisa9Q9CZN4 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Shisa9Q9CZN4 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Shisa9Q9CZN4 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Shisa9Q9CZN4 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Shisa9Q9CZN4 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Shisa9Q9CZN4 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Shisa9Q9CZN4 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Shisa9Q9CZN4 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Shisa9Q9CZN4 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Shisa9Q9CZN4 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Shisa9Q9CZN4 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Shisa9Q9CZN4 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Shisa9Q9CZN4 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Shisa9Q9CZN4 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Shisa9Q9CZN4 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Shisa9Q9CZN4 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Shisa9Q9CZN4 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Shisa9Q9CZN4 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Shisa9Q9CZN4 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Shisa9Q9CZN4 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Shisa9Q9CZN4 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Shisa9Q9CZN4 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Shisa9Q9CZN4 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Shisa9Q9CZN4 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Shisa9Q9CZN4 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Shisa9Q9CZN4 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Shisa9Q9CZN4 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Shisa9Q9CZN4 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Shisa9Q9CZN4 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Shisa9Q9CZN4 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Shisa9Q9CZN4 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Shisa9Q9CZN4 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Shisa9Q9CZN4 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Shisa9Q9CZN4 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Shisa9Q9CZN4 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Shisa9Q9CZN4 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Shisa9Q9CZN4 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Shisa9Q9CZN4 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Shisa9Q9CZN4 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Shisa9Q9CZN4 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Shisa9Q9CZN4 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Shisa9Q9CZN4 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Shisa9Q9CZN4 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Shisa9Q9CZN4 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Shisa9Q9CZN4 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Shisa9Q9CZN4 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Shisa9Q9CZN4 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Shisa9Q9CZN4 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Shisa9Q9CZN4 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Shisa9Q9CZN4 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Shisa9Q9CZN4 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Shisa9Q9CZN4 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Shisa9Q9CZN4 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Shisa9Q9CZN4 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Shisa9Q9CZN4 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Shisa9Q9CZN4 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Shisa9Q9CZN4 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Shisa9Q9CZN4 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Shisa9Q9CZN4 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Shisa9Q9CZN4 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Shisa9Q9CZN4 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Shisa9Q9CZN4 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Shisa9Q9CZN4 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Shisa9Q9CZN4 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Shisa9Q9CZN4 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Shisa9Q9CZN4 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Shisa9Q9CZN4 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Shisa9Q9CZN4 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Shisa9Q9CZN4 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Shisa9Q9CZN4 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Shisa9Q9CZN4 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Shisa9Q9CZN4 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Shisa9Q9CZN4 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Shisa9Q9CZN4 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Shisa9Q9CZN4 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Shisa9Q9CZN4 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Shisa9Q9CZN4 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Shisa9Q9CZN4 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Shisa9Q9CZN4 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Shisa9Q9CZN4 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Shisa9Q9CZN4 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Shisa9Q9CZN4 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Shisa9Q9CZN4 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Shisa9Q9CZN4 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Shisa9Q9CZN4 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Shisa9Q9CZN4 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Shisa9Q9CZN4 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Shisa9Q9CZN4 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Shisa9Q9CZN4 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Shisa9Q9CZN4 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Shisa9Q9CZN4 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Shisa9Q9CZN4 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Shisa9Q9CZN4 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Shisa9Q9CZN4 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Shisa9Q9CZN4 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Shisa9Q9CZN4 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms