Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZA6

Nde1, Nuclear distribution protein nudE homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nde1Q9CZA6 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nde1Q9CZA6 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nde1Q9CZA6 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nde1Q9CZA6 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nde1Q9CZA6 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nde1Q9CZA6 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nde1Q9CZA6 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nde1Q9CZA6 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nde1Q9CZA6 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nde1Q9CZA6 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nde1Q9CZA6 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nde1Q9CZA6 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nde1Q9CZA6 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nde1Q9CZA6 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nde1Q9CZA6 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nde1Q9CZA6 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nde1Q9CZA6 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nde1Q9CZA6 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nde1Q9CZA6 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nde1Q9CZA6 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nde1Q9CZA6 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nde1Q9CZA6 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nde1Q9CZA6 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nde1Q9CZA6 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nde1Q9CZA6 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nde1Q9CZA6 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nde1Q9CZA6 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nde1Q9CZA6 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nde1Q9CZA6 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Nde1Q9CZA6 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nde1Q9CZA6 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nde1Q9CZA6 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nde1Q9CZA6 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nde1Q9CZA6 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nde1Q9CZA6 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nde1Q9CZA6 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nde1Q9CZA6 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nde1Q9CZA6 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nde1Q9CZA6 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nde1Q9CZA6 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nde1Q9CZA6 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nde1Q9CZA6 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nde1Q9CZA6 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nde1Q9CZA6 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nde1Q9CZA6 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nde1Q9CZA6 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nde1Q9CZA6 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nde1Q9CZA6 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nde1Q9CZA6 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nde1Q9CZA6 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nde1Q9CZA6 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nde1Q9CZA6 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nde1Q9CZA6 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nde1Q9CZA6 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nde1Q9CZA6 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nde1Q9CZA6 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nde1Q9CZA6 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nde1Q9CZA6 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nde1Q9CZA6 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nde1Q9CZA6 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nde1Q9CZA6 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nde1Q9CZA6 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nde1Q9CZA6 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nde1Q9CZA6 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nde1Q9CZA6 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nde1Q9CZA6 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nde1Q9CZA6 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nde1Q9CZA6 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nde1Q9CZA6 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nde1Q9CZA6 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nde1Q9CZA6 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Nde1Q9CZA6 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nde1Q9CZA6 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nde1Q9CZA6 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nde1Q9CZA6 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nde1Q9CZA6 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nde1Q9CZA6 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nde1Q9CZA6 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nde1Q9CZA6 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nde1Q9CZA6 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nde1Q9CZA6 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nde1Q9CZA6 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nde1Q9CZA6 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nde1Q9CZA6 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nde1Q9CZA6 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nde1Q9CZA6 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nde1Q9CZA6 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nde1Q9CZA6 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nde1Q9CZA6 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nde1Q9CZA6 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nde1Q9CZA6 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nde1Q9CZA6 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nde1Q9CZA6 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nde1Q9CZA6 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nde1Q9CZA6 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nde1Q9CZA6 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nde1Q9CZA6 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nde1Q9CZA6 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nde1Q9CZA6 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nde1Q9CZA6 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms