Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ28

Snf8, Vacuolar-sorting protein SNF8, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snf8Q9CZ28 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Snf8Q9CZ28 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Snf8Q9CZ28 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Snf8Q9CZ28 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Snf8Q9CZ28 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snf8Q9CZ28 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snf8Q9CZ28 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snf8Q9CZ28 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snf8Q9CZ28 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snf8Q9CZ28 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snf8Q9CZ28 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Snf8Q9CZ28 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snf8Q9CZ28 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snf8Q9CZ28 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snf8Q9CZ28 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snf8Q9CZ28 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snf8Q9CZ28 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snf8Q9CZ28 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snf8Q9CZ28 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snf8Q9CZ28 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snf8Q9CZ28 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snf8Q9CZ28 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snf8Q9CZ28 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snf8Q9CZ28 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snf8Q9CZ28 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snf8Q9CZ28 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snf8Q9CZ28 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snf8Q9CZ28 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snf8Q9CZ28 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snf8Q9CZ28 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snf8Q9CZ28 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snf8Q9CZ28 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snf8Q9CZ28 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snf8Q9CZ28 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snf8Q9CZ28 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snf8Q9CZ28 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snf8Q9CZ28 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snf8Q9CZ28 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snf8Q9CZ28 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snf8Q9CZ28 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snf8Q9CZ28 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Snf8Q9CZ28 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Snf8Q9CZ28 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snf8Q9CZ28 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snf8Q9CZ28 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snf8Q9CZ28 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snf8Q9CZ28 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snf8Q9CZ28 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snf8Q9CZ28 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snf8Q9CZ28 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snf8Q9CZ28 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Snf8Q9CZ28 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Snf8Q9CZ28 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Snf8Q9CZ28 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Snf8Q9CZ28 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Snf8Q9CZ28 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Snf8Q9CZ28 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Snf8Q9CZ28 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Snf8Q9CZ28 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Snf8Q9CZ28 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Snf8Q9CZ28 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Snf8Q9CZ28 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Snf8Q9CZ28 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Snf8Q9CZ28 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Snf8Q9CZ28 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Snf8Q9CZ28 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Snf8Q9CZ28 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Snf8Q9CZ28 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Snf8Q9CZ28 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Snf8Q9CZ28 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Snf8Q9CZ28 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Snf8Q9CZ28 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Snf8Q9CZ28 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Snf8Q9CZ28 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Snf8Q9CZ28 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Snf8Q9CZ28 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Snf8Q9CZ28 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Snf8Q9CZ28 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Snf8Q9CZ28 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Snf8Q9CZ28 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Snf8Q9CZ28 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Snf8Q9CZ28 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Snf8Q9CZ28 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Snf8Q9CZ28 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Snf8Q9CZ28 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Snf8Q9CZ28 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Snf8Q9CZ28 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Snf8Q9CZ28 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Snf8Q9CZ28 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Snf8Q9CZ28 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Snf8Q9CZ28 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Snf8Q9CZ28 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Snf8Q9CZ28 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Snf8Q9CZ28 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Snf8Q9CZ28 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Snf8Q9CZ28 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Snf8Q9CZ28 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Snf8Q9CZ28 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Snf8Q9CZ28 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Snf8Q9CZ28 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms