Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY25

Mis12, Protein MIS12 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mis12Q9CY25 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mis12Q9CY25 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mis12Q9CY25 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mis12Q9CY25 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mis12Q9CY25 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mis12Q9CY25 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mis12Q9CY25 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mis12Q9CY25 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mis12Q9CY25 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mis12Q9CY25 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mis12Q9CY25 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mis12Q9CY25 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mis12Q9CY25 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mis12Q9CY25 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mis12Q9CY25 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mis12Q9CY25 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mis12Q9CY25 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mis12Q9CY25 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mis12Q9CY25 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mis12Q9CY25 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mis12Q9CY25 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mis12Q9CY25 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Mis12Q9CY25 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mis12Q9CY25 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Mis12Q9CY25 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mis12Q9CY25 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mis12Q9CY25 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mis12Q9CY25 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mis12Q9CY25 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mis12Q9CY25 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mis12Q9CY25 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mis12Q9CY25 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mis12Q9CY25 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Mis12Q9CY25 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mis12Q9CY25 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mis12Q9CY25 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mis12Q9CY25 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mis12Q9CY25 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mis12Q9CY25 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mis12Q9CY25 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mis12Q9CY25 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mis12Q9CY25 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mis12Q9CY25 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mis12Q9CY25 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mis12Q9CY25 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mis12Q9CY25 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mis12Q9CY25 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mis12Q9CY25 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mis12Q9CY25 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mis12Q9CY25 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mis12Q9CY25 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mis12Q9CY25 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mis12Q9CY25 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Mis12Q9CY25 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mis12Q9CY25 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mis12Q9CY25 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mis12Q9CY25 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mis12Q9CY25 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Mis12Q9CY25 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mis12Q9CY25 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Mis12Q9CY25 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mis12Q9CY25 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mis12Q9CY25 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Mis12Q9CY25 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mis12Q9CY25 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mis12Q9CY25 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mis12Q9CY25 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mis12Q9CY25 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mis12Q9CY25 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mis12Q9CY25 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mis12Q9CY25 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mis12Q9CY25 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mis12Q9CY25 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mis12Q9CY25 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mis12Q9CY25 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Mis12Q9CY25 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mis12Q9CY25 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Mis12Q9CY25 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mis12Q9CY25 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mis12Q9CY25 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mis12Q9CY25 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mis12Q9CY25 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mis12Q9CY25 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mis12Q9CY25 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mis12Q9CY25 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mis12Q9CY25 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mis12Q9CY25 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mis12Q9CY25 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mis12Q9CY25 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Mis12Q9CY25 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC18.21■□□□□ 0.5
Mis12Q9CY25 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mis12Q9CY25 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mis12Q9CY25 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mis12Q9CY25 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mis12Q9CY25 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mis12Q9CY25 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mis12Q9CY25 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mis12Q9CY25 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mis12Q9CY25 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mis12Q9CY25 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms