Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY18

Snx7, Sorting nexin-7, mousemouse

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx7Q9CY18 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snx7Q9CY18 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snx7Q9CY18 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snx7Q9CY18 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snx7Q9CY18 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snx7Q9CY18 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snx7Q9CY18 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snx7Q9CY18 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snx7Q9CY18 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snx7Q9CY18 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snx7Q9CY18 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snx7Q9CY18 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Snx7Q9CY18 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snx7Q9CY18 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snx7Q9CY18 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snx7Q9CY18 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snx7Q9CY18 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snx7Q9CY18 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snx7Q9CY18 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snx7Q9CY18 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snx7Q9CY18 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snx7Q9CY18 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snx7Q9CY18 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Snx7Q9CY18 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snx7Q9CY18 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snx7Q9CY18 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snx7Q9CY18 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snx7Q9CY18 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snx7Q9CY18 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snx7Q9CY18 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Snx7Q9CY18 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snx7Q9CY18 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snx7Q9CY18 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snx7Q9CY18 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snx7Q9CY18 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snx7Q9CY18 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snx7Q9CY18 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snx7Q9CY18 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snx7Q9CY18 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snx7Q9CY18 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snx7Q9CY18 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snx7Q9CY18 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snx7Q9CY18 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Snx7Q9CY18 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snx7Q9CY18 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snx7Q9CY18 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snx7Q9CY18 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snx7Q9CY18 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snx7Q9CY18 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snx7Q9CY18 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Snx7Q9CY18 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Snx7Q9CY18 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Snx7Q9CY18 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Snx7Q9CY18 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Snx7Q9CY18 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Snx7Q9CY18 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Snx7Q9CY18 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Snx7Q9CY18 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Snx7Q9CY18 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Snx7Q9CY18 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Snx7Q9CY18 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Snx7Q9CY18 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Snx7Q9CY18 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Snx7Q9CY18 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Snx7Q9CY18 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Snx7Q9CY18 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Snx7Q9CY18 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Snx7Q9CY18 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Snx7Q9CY18 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Snx7Q9CY18 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Snx7Q9CY18 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Snx7Q9CY18 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Snx7Q9CY18 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Snx7Q9CY18 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Snx7Q9CY18 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Snx7Q9CY18 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Snx7Q9CY18 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Snx7Q9CY18 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Snx7Q9CY18 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Snx7Q9CY18 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Snx7Q9CY18 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Snx7Q9CY18 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Snx7Q9CY18 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Snx7Q9CY18 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Snx7Q9CY18 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Snx7Q9CY18 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Snx7Q9CY18 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Snx7Q9CY18 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Snx7Q9CY18 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Snx7Q9CY18 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Snx7Q9CY18 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Snx7Q9CY18 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Snx7Q9CY18 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Snx7Q9CY18 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Snx7Q9CY18 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Snx7Q9CY18 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Snx7Q9CY18 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Snx7Q9CY18 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Snx7Q9CY18 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Snx7Q9CY18 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms