Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE7

Tmed5, Transmembrane emp24 domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed5Q9CXE7 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmed5Q9CXE7 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmed5Q9CXE7 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmed5Q9CXE7 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmed5Q9CXE7 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmed5Q9CXE7 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmed5Q9CXE7 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmed5Q9CXE7 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmed5Q9CXE7 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmed5Q9CXE7 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmed5Q9CXE7 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmed5Q9CXE7 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmed5Q9CXE7 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmed5Q9CXE7 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmed5Q9CXE7 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmed5Q9CXE7 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmed5Q9CXE7 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmed5Q9CXE7 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmed5Q9CXE7 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmed5Q9CXE7 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmed5Q9CXE7 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmed5Q9CXE7 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmed5Q9CXE7 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmed5Q9CXE7 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmed5Q9CXE7 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmed5Q9CXE7 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmed5Q9CXE7 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmed5Q9CXE7 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmed5Q9CXE7 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmed5Q9CXE7 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmed5Q9CXE7 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmed5Q9CXE7 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmed5Q9CXE7 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmed5Q9CXE7 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmed5Q9CXE7 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmed5Q9CXE7 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmed5Q9CXE7 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmed5Q9CXE7 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmed5Q9CXE7 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmed5Q9CXE7 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmed5Q9CXE7 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmed5Q9CXE7 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmed5Q9CXE7 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmed5Q9CXE7 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmed5Q9CXE7 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmed5Q9CXE7 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmed5Q9CXE7 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmed5Q9CXE7 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmed5Q9CXE7 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmed5Q9CXE7 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmed5Q9CXE7 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmed5Q9CXE7 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmed5Q9CXE7 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmed5Q9CXE7 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmed5Q9CXE7 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmed5Q9CXE7 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmed5Q9CXE7 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmed5Q9CXE7 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmed5Q9CXE7 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmed5Q9CXE7 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmed5Q9CXE7 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmed5Q9CXE7 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmed5Q9CXE7 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmed5Q9CXE7 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmed5Q9CXE7 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmed5Q9CXE7 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmed5Q9CXE7 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmed5Q9CXE7 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmed5Q9CXE7 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmed5Q9CXE7 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmed5Q9CXE7 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmed5Q9CXE7 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmed5Q9CXE7 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmed5Q9CXE7 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmed5Q9CXE7 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmed5Q9CXE7 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmed5Q9CXE7 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmed5Q9CXE7 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmed5Q9CXE7 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmed5Q9CXE7 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmed5Q9CXE7 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmed5Q9CXE7 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmed5Q9CXE7 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmed5Q9CXE7 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmed5Q9CXE7 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmed5Q9CXE7 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmed5Q9CXE7 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmed5Q9CXE7 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmed5Q9CXE7 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmed5Q9CXE7 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmed5Q9CXE7 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmed5Q9CXE7 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmed5Q9CXE7 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmed5Q9CXE7 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmed5Q9CXE7 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmed5Q9CXE7 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmed5Q9CXE7 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmed5Q9CXE7 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmed5Q9CXE7 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmed5Q9CXE7 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms