Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXC3

Mgme1, Mitochondrial genome maintenance exonuclease 1, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mgme1Q9CXC3 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mgme1Q9CXC3 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mgme1Q9CXC3 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mgme1Q9CXC3 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mgme1Q9CXC3 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mgme1Q9CXC3 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mgme1Q9CXC3 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mgme1Q9CXC3 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Mgme1Q9CXC3 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mgme1Q9CXC3 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mgme1Q9CXC3 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Mgme1Q9CXC3 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mgme1Q9CXC3 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mgme1Q9CXC3 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mgme1Q9CXC3 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mgme1Q9CXC3 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mgme1Q9CXC3 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mgme1Q9CXC3 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mgme1Q9CXC3 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mgme1Q9CXC3 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mgme1Q9CXC3 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mgme1Q9CXC3 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mgme1Q9CXC3 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mgme1Q9CXC3 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mgme1Q9CXC3 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mgme1Q9CXC3 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mgme1Q9CXC3 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mgme1Q9CXC3 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mgme1Q9CXC3 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mgme1Q9CXC3 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mgme1Q9CXC3 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mgme1Q9CXC3 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mgme1Q9CXC3 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mgme1Q9CXC3 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mgme1Q9CXC3 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mgme1Q9CXC3 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mgme1Q9CXC3 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mgme1Q9CXC3 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mgme1Q9CXC3 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mgme1Q9CXC3 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mgme1Q9CXC3 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Mgme1Q9CXC3 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mgme1Q9CXC3 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mgme1Q9CXC3 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mgme1Q9CXC3 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mgme1Q9CXC3 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Mgme1Q9CXC3 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Mgme1Q9CXC3 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mgme1Q9CXC3 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mgme1Q9CXC3 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mgme1Q9CXC3 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mgme1Q9CXC3 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mgme1Q9CXC3 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mgme1Q9CXC3 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mgme1Q9CXC3 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mgme1Q9CXC3 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mgme1Q9CXC3 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mgme1Q9CXC3 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mgme1Q9CXC3 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mgme1Q9CXC3 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Mgme1Q9CXC3 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mgme1Q9CXC3 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mgme1Q9CXC3 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mgme1Q9CXC3 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mgme1Q9CXC3 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mgme1Q9CXC3 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mgme1Q9CXC3 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mgme1Q9CXC3 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mgme1Q9CXC3 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mgme1Q9CXC3 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mgme1Q9CXC3 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mgme1Q9CXC3 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Mgme1Q9CXC3 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mgme1Q9CXC3 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mgme1Q9CXC3 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mgme1Q9CXC3 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mgme1Q9CXC3 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mgme1Q9CXC3 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mgme1Q9CXC3 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mgme1Q9CXC3 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mgme1Q9CXC3 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Mgme1Q9CXC3 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mgme1Q9CXC3 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mgme1Q9CXC3 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mgme1Q9CXC3 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mgme1Q9CXC3 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mgme1Q9CXC3 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mgme1Q9CXC3 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mgme1Q9CXC3 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mgme1Q9CXC3 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mgme1Q9CXC3 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mgme1Q9CXC3 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mgme1Q9CXC3 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mgme1Q9CXC3 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mgme1Q9CXC3 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mgme1Q9CXC3 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mgme1Q9CXC3 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mgme1Q9CXC3 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mgme1Q9CXC3 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mgme1Q9CXC3 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms