Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX13

Cnih4, Protein cornichon homolog 4, mousemouse

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih4Q9CX13 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cnih4Q9CX13 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Cnih4Q9CX13 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cnih4Q9CX13 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cnih4Q9CX13 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cnih4Q9CX13 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cnih4Q9CX13 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cnih4Q9CX13 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cnih4Q9CX13 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cnih4Q9CX13 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cnih4Q9CX13 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cnih4Q9CX13 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cnih4Q9CX13 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cnih4Q9CX13 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cnih4Q9CX13 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cnih4Q9CX13 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cnih4Q9CX13 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cnih4Q9CX13 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cnih4Q9CX13 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cnih4Q9CX13 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cnih4Q9CX13 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cnih4Q9CX13 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cnih4Q9CX13 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cnih4Q9CX13 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cnih4Q9CX13 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cnih4Q9CX13 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cnih4Q9CX13 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cnih4Q9CX13 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cnih4Q9CX13 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cnih4Q9CX13 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cnih4Q9CX13 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cnih4Q9CX13 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cnih4Q9CX13 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cnih4Q9CX13 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Cnih4Q9CX13 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cnih4Q9CX13 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cnih4Q9CX13 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnih4Q9CX13 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnih4Q9CX13 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnih4Q9CX13 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnih4Q9CX13 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnih4Q9CX13 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnih4Q9CX13 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnih4Q9CX13 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnih4Q9CX13 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnih4Q9CX13 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnih4Q9CX13 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnih4Q9CX13 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnih4Q9CX13 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnih4Q9CX13 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnih4Q9CX13 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnih4Q9CX13 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnih4Q9CX13 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnih4Q9CX13 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnih4Q9CX13 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnih4Q9CX13 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnih4Q9CX13 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnih4Q9CX13 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnih4Q9CX13 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnih4Q9CX13 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnih4Q9CX13 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnih4Q9CX13 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnih4Q9CX13 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnih4Q9CX13 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnih4Q9CX13 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnih4Q9CX13 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cnih4Q9CX13 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cnih4Q9CX13 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cnih4Q9CX13 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cnih4Q9CX13 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cnih4Q9CX13 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cnih4Q9CX13 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cnih4Q9CX13 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cnih4Q9CX13 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cnih4Q9CX13 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cnih4Q9CX13 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cnih4Q9CX13 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Cnih4Q9CX13 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cnih4Q9CX13 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cnih4Q9CX13 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cnih4Q9CX13 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cnih4Q9CX13 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cnih4Q9CX13 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cnih4Q9CX13 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cnih4Q9CX13 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cnih4Q9CX13 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cnih4Q9CX13 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cnih4Q9CX13 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnih4Q9CX13 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnih4Q9CX13 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnih4Q9CX13 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnih4Q9CX13 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnih4Q9CX13 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnih4Q9CX13 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnih4Q9CX13 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnih4Q9CX13 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnih4Q9CX13 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnih4Q9CX13 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnih4Q9CX13 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnih4Q9CX13 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms