Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX00

Ist1, IST1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ist1Q9CX00 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ist1Q9CX00 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ist1Q9CX00 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ist1Q9CX00 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ist1Q9CX00 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ist1Q9CX00 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ist1Q9CX00 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ist1Q9CX00 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ist1Q9CX00 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ist1Q9CX00 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ist1Q9CX00 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ist1Q9CX00 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ist1Q9CX00 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ist1Q9CX00 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ist1Q9CX00 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ist1Q9CX00 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ist1Q9CX00 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ist1Q9CX00 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ist1Q9CX00 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ist1Q9CX00 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ist1Q9CX00 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ist1Q9CX00 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ist1Q9CX00 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ist1Q9CX00 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ist1Q9CX00 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ist1Q9CX00 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ist1Q9CX00 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ist1Q9CX00 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ist1Q9CX00 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ist1Q9CX00 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ist1Q9CX00 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ist1Q9CX00 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ist1Q9CX00 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ist1Q9CX00 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ist1Q9CX00 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ist1Q9CX00 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ist1Q9CX00 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ist1Q9CX00 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ist1Q9CX00 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ist1Q9CX00 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ist1Q9CX00 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ist1Q9CX00 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ist1Q9CX00 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ist1Q9CX00 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ist1Q9CX00 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ist1Q9CX00 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ist1Q9CX00 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ist1Q9CX00 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ist1Q9CX00 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ist1Q9CX00 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ist1Q9CX00 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ist1Q9CX00 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ist1Q9CX00 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ist1Q9CX00 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ist1Q9CX00 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ist1Q9CX00 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ist1Q9CX00 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ist1Q9CX00 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ist1Q9CX00 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ist1Q9CX00 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ist1Q9CX00 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ist1Q9CX00 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ist1Q9CX00 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ist1Q9CX00 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ist1Q9CX00 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ist1Q9CX00 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ist1Q9CX00 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ist1Q9CX00 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ist1Q9CX00 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ist1Q9CX00 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ist1Q9CX00 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ist1Q9CX00 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ist1Q9CX00 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ist1Q9CX00 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ist1Q9CX00 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ist1Q9CX00 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ist1Q9CX00 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ist1Q9CX00 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ist1Q9CX00 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ist1Q9CX00 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ist1Q9CX00 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ist1Q9CX00 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ist1Q9CX00 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ist1Q9CX00 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ist1Q9CX00 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ist1Q9CX00 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ist1Q9CX00 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ist1Q9CX00 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ist1Q9CX00 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ist1Q9CX00 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ist1Q9CX00 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ist1Q9CX00 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ist1Q9CX00 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ist1Q9CX00 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ist1Q9CX00 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ist1Q9CX00 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ist1Q9CX00 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ist1Q9CX00 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ist1Q9CX00 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ist1Q9CX00 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.7 ms