Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RpainQ9CWY9 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RpainQ9CWY9 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RpainQ9CWY9 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RpainQ9CWY9 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RpainQ9CWY9 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RpainQ9CWY9 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RpainQ9CWY9 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RpainQ9CWY9 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RpainQ9CWY9 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RpainQ9CWY9 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RpainQ9CWY9 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RpainQ9CWY9 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RpainQ9CWY9 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RpainQ9CWY9 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RpainQ9CWY9 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RpainQ9CWY9 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RpainQ9CWY9 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RpainQ9CWY9 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
RpainQ9CWY9 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RpainQ9CWY9 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
RpainQ9CWY9 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RpainQ9CWY9 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
RpainQ9CWY9 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RpainQ9CWY9 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RpainQ9CWY9 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RpainQ9CWY9 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RpainQ9CWY9 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RpainQ9CWY9 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RpainQ9CWY9 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RpainQ9CWY9 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RpainQ9CWY9 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RpainQ9CWY9 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RpainQ9CWY9 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RpainQ9CWY9 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RpainQ9CWY9 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RpainQ9CWY9 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RpainQ9CWY9 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
RpainQ9CWY9 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RpainQ9CWY9 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RpainQ9CWY9 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RpainQ9CWY9 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RpainQ9CWY9 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RpainQ9CWY9 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RpainQ9CWY9 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RpainQ9CWY9 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RpainQ9CWY9 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RpainQ9CWY9 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RpainQ9CWY9 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RpainQ9CWY9 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RpainQ9CWY9 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RpainQ9CWY9 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RpainQ9CWY9 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RpainQ9CWY9 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RpainQ9CWY9 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RpainQ9CWY9 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RpainQ9CWY9 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RpainQ9CWY9 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RpainQ9CWY9 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RpainQ9CWY9 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RpainQ9CWY9 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RpainQ9CWY9 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RpainQ9CWY9 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RpainQ9CWY9 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RpainQ9CWY9 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
RpainQ9CWY9 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
RpainQ9CWY9 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RpainQ9CWY9 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RpainQ9CWY9 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RpainQ9CWY9 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
RpainQ9CWY9 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
RpainQ9CWY9 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
RpainQ9CWY9 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RpainQ9CWY9 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RpainQ9CWY9 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RpainQ9CWY9 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RpainQ9CWY9 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RpainQ9CWY9 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
RpainQ9CWY9 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RpainQ9CWY9 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RpainQ9CWY9 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RpainQ9CWY9 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RpainQ9CWY9 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RpainQ9CWY9 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RpainQ9CWY9 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RpainQ9CWY9 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RpainQ9CWY9 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RpainQ9CWY9 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RpainQ9CWY9 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RpainQ9CWY9 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
RpainQ9CWY9 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
RpainQ9CWY9 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
RpainQ9CWY9 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
RpainQ9CWY9 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RpainQ9CWY9 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
RpainQ9CWY9 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RpainQ9CWY9 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RpainQ9CWY9 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RpainQ9CWY9 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RpainQ9CWY9 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
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