Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWT6

Ddx28, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx28Q9CWT6 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
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Ddx28Q9CWT6 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ddx28Q9CWT6 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ddx28Q9CWT6 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ddx28Q9CWT6 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ddx28Q9CWT6 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ddx28Q9CWT6 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ddx28Q9CWT6 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ddx28Q9CWT6 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ddx28Q9CWT6 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ddx28Q9CWT6 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ddx28Q9CWT6 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ddx28Q9CWT6 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ddx28Q9CWT6 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ddx28Q9CWT6 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ddx28Q9CWT6 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ddx28Q9CWT6 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ddx28Q9CWT6 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ddx28Q9CWT6 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ddx28Q9CWT6 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ddx28Q9CWT6 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ddx28Q9CWT6 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ddx28Q9CWT6 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ddx28Q9CWT6 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ddx28Q9CWT6 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ddx28Q9CWT6 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ddx28Q9CWT6 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ddx28Q9CWT6 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ddx28Q9CWT6 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ddx28Q9CWT6 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ddx28Q9CWT6 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ddx28Q9CWT6 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ddx28Q9CWT6 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ddx28Q9CWT6 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ddx28Q9CWT6 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ddx28Q9CWT6 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ddx28Q9CWT6 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ddx28Q9CWT6 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
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Ddx28Q9CWT6 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ddx28Q9CWT6 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ddx28Q9CWT6 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ddx28Q9CWT6 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ddx28Q9CWT6 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ddx28Q9CWT6 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ddx28Q9CWT6 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ddx28Q9CWT6 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ddx28Q9CWT6 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ddx28Q9CWT6 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
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Ddx28Q9CWT6 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Ddx28Q9CWT6 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
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Ddx28Q9CWT6 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Ddx28Q9CWT6 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Ddx28Q9CWT6 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddx28Q9CWT6 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddx28Q9CWT6 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddx28Q9CWT6 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddx28Q9CWT6 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddx28Q9CWT6 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddx28Q9CWT6 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddx28Q9CWT6 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddx28Q9CWT6 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddx28Q9CWT6 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddx28Q9CWT6 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddx28Q9CWT6 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddx28Q9CWT6 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddx28Q9CWT6 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddx28Q9CWT6 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddx28Q9CWT6 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddx28Q9CWT6 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddx28Q9CWT6 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddx28Q9CWT6 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddx28Q9CWT6 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddx28Q9CWT6 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddx28Q9CWT6 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddx28Q9CWT6 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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