Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWT3

Snx10, Sorting nexin-10, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx10Q9CWT3 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Snx10Q9CWT3 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snx10Q9CWT3 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snx10Q9CWT3 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snx10Q9CWT3 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snx10Q9CWT3 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snx10Q9CWT3 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snx10Q9CWT3 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Snx10Q9CWT3 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snx10Q9CWT3 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snx10Q9CWT3 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snx10Q9CWT3 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snx10Q9CWT3 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snx10Q9CWT3 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snx10Q9CWT3 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Snx10Q9CWT3 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Snx10Q9CWT3 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Snx10Q9CWT3 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Snx10Q9CWT3 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Snx10Q9CWT3 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Snx10Q9CWT3 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Snx10Q9CWT3 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Snx10Q9CWT3 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Snx10Q9CWT3 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Snx10Q9CWT3 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Snx10Q9CWT3 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Snx10Q9CWT3 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Snx10Q9CWT3 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Snx10Q9CWT3 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Snx10Q9CWT3 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Snx10Q9CWT3 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Snx10Q9CWT3 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Snx10Q9CWT3 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Snx10Q9CWT3 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Snx10Q9CWT3 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Snx10Q9CWT3 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Snx10Q9CWT3 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Snx10Q9CWT3 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Snx10Q9CWT3 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Snx10Q9CWT3 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Snx10Q9CWT3 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Snx10Q9CWT3 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Snx10Q9CWT3 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Snx10Q9CWT3 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Snx10Q9CWT3 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Snx10Q9CWT3 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Snx10Q9CWT3 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Snx10Q9CWT3 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snx10Q9CWT3 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snx10Q9CWT3 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snx10Q9CWT3 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snx10Q9CWT3 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snx10Q9CWT3 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snx10Q9CWT3 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snx10Q9CWT3 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snx10Q9CWT3 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snx10Q9CWT3 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snx10Q9CWT3 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snx10Q9CWT3 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snx10Q9CWT3 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snx10Q9CWT3 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snx10Q9CWT3 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snx10Q9CWT3 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snx10Q9CWT3 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snx10Q9CWT3 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snx10Q9CWT3 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snx10Q9CWT3 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Snx10Q9CWT3 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snx10Q9CWT3 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snx10Q9CWT3 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snx10Q9CWT3 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snx10Q9CWT3 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snx10Q9CWT3 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snx10Q9CWT3 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snx10Q9CWT3 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snx10Q9CWT3 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snx10Q9CWT3 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snx10Q9CWT3 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snx10Q9CWT3 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Snx10Q9CWT3 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Snx10Q9CWT3 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Snx10Q9CWT3 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Snx10Q9CWT3 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Snx10Q9CWT3 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Snx10Q9CWT3 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Snx10Q9CWT3 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Snx10Q9CWT3 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Snx10Q9CWT3 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Snx10Q9CWT3 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Snx10Q9CWT3 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Snx10Q9CWT3 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Snx10Q9CWT3 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Snx10Q9CWT3 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Snx10Q9CWT3 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Snx10Q9CWT3 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Snx10Q9CWT3 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Snx10Q9CWT3 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Snx10Q9CWT3 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Snx10Q9CWT3 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snx10Q9CWT3 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms