Protein–RNA interactions for Protein: Q9CS72

Filip1, Filamin-A-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Filip1Q9CS72 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Filip1Q9CS72 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Filip1Q9CS72 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Filip1Q9CS72 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Filip1Q9CS72 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Filip1Q9CS72 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Filip1Q9CS72 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Filip1Q9CS72 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Filip1Q9CS72 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Filip1Q9CS72 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Filip1Q9CS72 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Filip1Q9CS72 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Filip1Q9CS72 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Filip1Q9CS72 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Filip1Q9CS72 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Filip1Q9CS72 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Filip1Q9CS72 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Filip1Q9CS72 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Filip1Q9CS72 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Filip1Q9CS72 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Filip1Q9CS72 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Filip1Q9CS72 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Filip1Q9CS72 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Filip1Q9CS72 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Filip1Q9CS72 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Filip1Q9CS72 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Filip1Q9CS72 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Filip1Q9CS72 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Filip1Q9CS72 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Filip1Q9CS72 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Filip1Q9CS72 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Filip1Q9CS72 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Filip1Q9CS72 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Filip1Q9CS72 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Filip1Q9CS72 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Filip1Q9CS72 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Filip1Q9CS72 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Filip1Q9CS72 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Filip1Q9CS72 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Filip1Q9CS72 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Filip1Q9CS72 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Filip1Q9CS72 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Filip1Q9CS72 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Filip1Q9CS72 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Filip1Q9CS72 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Filip1Q9CS72 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Filip1Q9CS72 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Filip1Q9CS72 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Filip1Q9CS72 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Filip1Q9CS72 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Filip1Q9CS72 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Filip1Q9CS72 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Filip1Q9CS72 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Filip1Q9CS72 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Filip1Q9CS72 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Filip1Q9CS72 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Filip1Q9CS72 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Filip1Q9CS72 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Filip1Q9CS72 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Filip1Q9CS72 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Filip1Q9CS72 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Filip1Q9CS72 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Filip1Q9CS72 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Filip1Q9CS72 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Filip1Q9CS72 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Filip1Q9CS72 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Filip1Q9CS72 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Filip1Q9CS72 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Filip1Q9CS72 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Filip1Q9CS72 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Filip1Q9CS72 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Filip1Q9CS72 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Filip1Q9CS72 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Filip1Q9CS72 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Filip1Q9CS72 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Filip1Q9CS72 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Filip1Q9CS72 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Filip1Q9CS72 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Filip1Q9CS72 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Filip1Q9CS72 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Filip1Q9CS72 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Filip1Q9CS72 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Filip1Q9CS72 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Filip1Q9CS72 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Filip1Q9CS72 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Filip1Q9CS72 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Filip1Q9CS72 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Filip1Q9CS72 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Filip1Q9CS72 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Filip1Q9CS72 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Filip1Q9CS72 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Filip1Q9CS72 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Filip1Q9CS72 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Filip1Q9CS72 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Filip1Q9CS72 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Filip1Q9CS72 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Filip1Q9CS72 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Filip1Q9CS72 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Filip1Q9CS72 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Filip1Q9CS72 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms