Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRB9

Chchd3, MICOS complex subunit Mic19, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chchd3Q9CRB9 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Chchd3Q9CRB9 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Chchd3Q9CRB9 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Chchd3Q9CRB9 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Chchd3Q9CRB9 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Chchd3Q9CRB9 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Chchd3Q9CRB9 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Chchd3Q9CRB9 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Chchd3Q9CRB9 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Chchd3Q9CRB9 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Chchd3Q9CRB9 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Chchd3Q9CRB9 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Chchd3Q9CRB9 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Chchd3Q9CRB9 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Chchd3Q9CRB9 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Chchd3Q9CRB9 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Chchd3Q9CRB9 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Chchd3Q9CRB9 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Chchd3Q9CRB9 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Chchd3Q9CRB9 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Chchd3Q9CRB9 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Chchd3Q9CRB9 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Chchd3Q9CRB9 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Chchd3Q9CRB9 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Chchd3Q9CRB9 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Chchd3Q9CRB9 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Chchd3Q9CRB9 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Chchd3Q9CRB9 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Chchd3Q9CRB9 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Chchd3Q9CRB9 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Chchd3Q9CRB9 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Chchd3Q9CRB9 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Chchd3Q9CRB9 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Chchd3Q9CRB9 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Chchd3Q9CRB9 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Chchd3Q9CRB9 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Chchd3Q9CRB9 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Chchd3Q9CRB9 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Chchd3Q9CRB9 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Chchd3Q9CRB9 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Chchd3Q9CRB9 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Chchd3Q9CRB9 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Chchd3Q9CRB9 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Chchd3Q9CRB9 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Chchd3Q9CRB9 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Chchd3Q9CRB9 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Chchd3Q9CRB9 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Chchd3Q9CRB9 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Chchd3Q9CRB9 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Chchd3Q9CRB9 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Chchd3Q9CRB9 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Chchd3Q9CRB9 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Chchd3Q9CRB9 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Chchd3Q9CRB9 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Chchd3Q9CRB9 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Chchd3Q9CRB9 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Chchd3Q9CRB9 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Chchd3Q9CRB9 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Chchd3Q9CRB9 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Chchd3Q9CRB9 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Chchd3Q9CRB9 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Chchd3Q9CRB9 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Chchd3Q9CRB9 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Chchd3Q9CRB9 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Chchd3Q9CRB9 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Chchd3Q9CRB9 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Chchd3Q9CRB9 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Chchd3Q9CRB9 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Chchd3Q9CRB9 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Chchd3Q9CRB9 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Chchd3Q9CRB9 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Chchd3Q9CRB9 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Chchd3Q9CRB9 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Chchd3Q9CRB9 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Chchd3Q9CRB9 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Chchd3Q9CRB9 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Chchd3Q9CRB9 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Chchd3Q9CRB9 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Chchd3Q9CRB9 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Chchd3Q9CRB9 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Chchd3Q9CRB9 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Chchd3Q9CRB9 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Chchd3Q9CRB9 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Chchd3Q9CRB9 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Chchd3Q9CRB9 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Chchd3Q9CRB9 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Chchd3Q9CRB9 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Chchd3Q9CRB9 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Chchd3Q9CRB9 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Chchd3Q9CRB9 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Chchd3Q9CRB9 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Chchd3Q9CRB9 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Chchd3Q9CRB9 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Chchd3Q9CRB9 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Chchd3Q9CRB9 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Chchd3Q9CRB9 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Chchd3Q9CRB9 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Chchd3Q9CRB9 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Chchd3Q9CRB9 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Chchd3Q9CRB9 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms