Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRA8

Exosc5, Exosome complex component RRP46, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exosc5Q9CRA8 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Exosc5Q9CRA8 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Exosc5Q9CRA8 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Exosc5Q9CRA8 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Exosc5Q9CRA8 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Exosc5Q9CRA8 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Exosc5Q9CRA8 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Exosc5Q9CRA8 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Exosc5Q9CRA8 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Exosc5Q9CRA8 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Exosc5Q9CRA8 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Exosc5Q9CRA8 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Exosc5Q9CRA8 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Exosc5Q9CRA8 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Exosc5Q9CRA8 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Exosc5Q9CRA8 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Exosc5Q9CRA8 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Exosc5Q9CRA8 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Exosc5Q9CRA8 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Exosc5Q9CRA8 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Exosc5Q9CRA8 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Exosc5Q9CRA8 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Exosc5Q9CRA8 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Exosc5Q9CRA8 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Exosc5Q9CRA8 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Exosc5Q9CRA8 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Exosc5Q9CRA8 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Exosc5Q9CRA8 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Exosc5Q9CRA8 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Exosc5Q9CRA8 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Exosc5Q9CRA8 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Exosc5Q9CRA8 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Exosc5Q9CRA8 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Exosc5Q9CRA8 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Exosc5Q9CRA8 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Exosc5Q9CRA8 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Exosc5Q9CRA8 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Exosc5Q9CRA8 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Exosc5Q9CRA8 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Exosc5Q9CRA8 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Exosc5Q9CRA8 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Exosc5Q9CRA8 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Exosc5Q9CRA8 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Exosc5Q9CRA8 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Exosc5Q9CRA8 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Exosc5Q9CRA8 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Exosc5Q9CRA8 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Exosc5Q9CRA8 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Exosc5Q9CRA8 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Exosc5Q9CRA8 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Exosc5Q9CRA8 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Exosc5Q9CRA8 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Exosc5Q9CRA8 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Exosc5Q9CRA8 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Exosc5Q9CRA8 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Exosc5Q9CRA8 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Exosc5Q9CRA8 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Exosc5Q9CRA8 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Exosc5Q9CRA8 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Exosc5Q9CRA8 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Exosc5Q9CRA8 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Exosc5Q9CRA8 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Exosc5Q9CRA8 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Exosc5Q9CRA8 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Exosc5Q9CRA8 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Exosc5Q9CRA8 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Exosc5Q9CRA8 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Exosc5Q9CRA8 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Exosc5Q9CRA8 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Exosc5Q9CRA8 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Exosc5Q9CRA8 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Exosc5Q9CRA8 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Exosc5Q9CRA8 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Exosc5Q9CRA8 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Exosc5Q9CRA8 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Exosc5Q9CRA8 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Exosc5Q9CRA8 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Exosc5Q9CRA8 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Exosc5Q9CRA8 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Exosc5Q9CRA8 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Exosc5Q9CRA8 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Exosc5Q9CRA8 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Exosc5Q9CRA8 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Exosc5Q9CRA8 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Exosc5Q9CRA8 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Exosc5Q9CRA8 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Exosc5Q9CRA8 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Exosc5Q9CRA8 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Exosc5Q9CRA8 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Exosc5Q9CRA8 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Exosc5Q9CRA8 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Exosc5Q9CRA8 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Exosc5Q9CRA8 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Exosc5Q9CRA8 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Exosc5Q9CRA8 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Exosc5Q9CRA8 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Exosc5Q9CRA8 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Exosc5Q9CRA8 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Exosc5Q9CRA8 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Exosc5Q9CRA8 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms