Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR40

Klhl28, Kelch-like protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl28Q9CR40 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Klhl28Q9CR40 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Klhl28Q9CR40 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Klhl28Q9CR40 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Klhl28Q9CR40 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Klhl28Q9CR40 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Klhl28Q9CR40 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Klhl28Q9CR40 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Klhl28Q9CR40 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Klhl28Q9CR40 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Klhl28Q9CR40 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Klhl28Q9CR40 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Klhl28Q9CR40 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Klhl28Q9CR40 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Klhl28Q9CR40 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Klhl28Q9CR40 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Klhl28Q9CR40 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Klhl28Q9CR40 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Klhl28Q9CR40 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Klhl28Q9CR40 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Klhl28Q9CR40 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Klhl28Q9CR40 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Klhl28Q9CR40 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Klhl28Q9CR40 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Klhl28Q9CR40 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Klhl28Q9CR40 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Klhl28Q9CR40 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Klhl28Q9CR40 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Klhl28Q9CR40 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Klhl28Q9CR40 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Klhl28Q9CR40 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Klhl28Q9CR40 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Klhl28Q9CR40 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Klhl28Q9CR40 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Klhl28Q9CR40 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Klhl28Q9CR40 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Klhl28Q9CR40 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Klhl28Q9CR40 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Klhl28Q9CR40 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Klhl28Q9CR40 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Klhl28Q9CR40 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Klhl28Q9CR40 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Klhl28Q9CR40 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Klhl28Q9CR40 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Klhl28Q9CR40 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Klhl28Q9CR40 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Klhl28Q9CR40 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Klhl28Q9CR40 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Klhl28Q9CR40 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Klhl28Q9CR40 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Klhl28Q9CR40 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Klhl28Q9CR40 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Klhl28Q9CR40 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Klhl28Q9CR40 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Klhl28Q9CR40 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Klhl28Q9CR40 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Klhl28Q9CR40 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Klhl28Q9CR40 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Klhl28Q9CR40 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Klhl28Q9CR40 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Klhl28Q9CR40 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Klhl28Q9CR40 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Klhl28Q9CR40 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Klhl28Q9CR40 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Klhl28Q9CR40 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Klhl28Q9CR40 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Klhl28Q9CR40 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Klhl28Q9CR40 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Klhl28Q9CR40 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Klhl28Q9CR40 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Klhl28Q9CR40 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Klhl28Q9CR40 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Klhl28Q9CR40 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Klhl28Q9CR40 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Klhl28Q9CR40 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Klhl28Q9CR40 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Klhl28Q9CR40 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Klhl28Q9CR40 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Klhl28Q9CR40 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Klhl28Q9CR40 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Klhl28Q9CR40 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Klhl28Q9CR40 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Klhl28Q9CR40 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Klhl28Q9CR40 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Klhl28Q9CR40 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Klhl28Q9CR40 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Klhl28Q9CR40 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Klhl28Q9CR40 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Klhl28Q9CR40 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Klhl28Q9CR40 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Klhl28Q9CR40 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Klhl28Q9CR40 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Klhl28Q9CR40 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Klhl28Q9CR40 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Klhl28Q9CR40 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Klhl28Q9CR40 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Klhl28Q9CR40 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Klhl28Q9CR40 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Klhl28Q9CR40 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Klhl28Q9CR40 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms