Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR05

4931417E11Rik, RIKEN cDNA 4931417E11, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931417E11RikQ9CR05 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
4931417E11RikQ9CR05 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
4931417E11RikQ9CR05 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
4931417E11RikQ9CR05 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
4931417E11RikQ9CR05 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
4931417E11RikQ9CR05 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
4931417E11RikQ9CR05 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
4931417E11RikQ9CR05 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
4931417E11RikQ9CR05 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
4931417E11RikQ9CR05 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
4931417E11RikQ9CR05 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
4931417E11RikQ9CR05 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
4931417E11RikQ9CR05 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
4931417E11RikQ9CR05 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
4931417E11RikQ9CR05 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
4931417E11RikQ9CR05 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
4931417E11RikQ9CR05 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
4931417E11RikQ9CR05 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
4931417E11RikQ9CR05 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
4931417E11RikQ9CR05 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
4931417E11RikQ9CR05 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
4931417E11RikQ9CR05 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
4931417E11RikQ9CR05 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
4931417E11RikQ9CR05 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
4931417E11RikQ9CR05 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
4931417E11RikQ9CR05 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
4931417E11RikQ9CR05 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
4931417E11RikQ9CR05 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
4931417E11RikQ9CR05 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
4931417E11RikQ9CR05 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
4931417E11RikQ9CR05 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
4931417E11RikQ9CR05 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
4931417E11RikQ9CR05 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
4931417E11RikQ9CR05 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
4931417E11RikQ9CR05 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
4931417E11RikQ9CR05 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
4931417E11RikQ9CR05 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
4931417E11RikQ9CR05 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
4931417E11RikQ9CR05 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4931417E11RikQ9CR05 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
4931417E11RikQ9CR05 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
4931417E11RikQ9CR05 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4931417E11RikQ9CR05 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4931417E11RikQ9CR05 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4931417E11RikQ9CR05 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4931417E11RikQ9CR05 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
4931417E11RikQ9CR05 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4931417E11RikQ9CR05 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4931417E11RikQ9CR05 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
4931417E11RikQ9CR05 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4931417E11RikQ9CR05 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
4931417E11RikQ9CR05 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4931417E11RikQ9CR05 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4931417E11RikQ9CR05 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4931417E11RikQ9CR05 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4931417E11RikQ9CR05 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
4931417E11RikQ9CR05 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4931417E11RikQ9CR05 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4931417E11RikQ9CR05 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4931417E11RikQ9CR05 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4931417E11RikQ9CR05 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4931417E11RikQ9CR05 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4931417E11RikQ9CR05 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4931417E11RikQ9CR05 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
4931417E11RikQ9CR05 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4931417E11RikQ9CR05 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4931417E11RikQ9CR05 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
4931417E11RikQ9CR05 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
4931417E11RikQ9CR05 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
4931417E11RikQ9CR05 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
4931417E11RikQ9CR05 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
4931417E11RikQ9CR05 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
4931417E11RikQ9CR05 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
4931417E11RikQ9CR05 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
4931417E11RikQ9CR05 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
4931417E11RikQ9CR05 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
4931417E11RikQ9CR05 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
4931417E11RikQ9CR05 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
4931417E11RikQ9CR05 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
4931417E11RikQ9CR05 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
4931417E11RikQ9CR05 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
4931417E11RikQ9CR05 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
4931417E11RikQ9CR05 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
4931417E11RikQ9CR05 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
4931417E11RikQ9CR05 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
4931417E11RikQ9CR05 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
4931417E11RikQ9CR05 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
4931417E11RikQ9CR05 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
4931417E11RikQ9CR05 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
4931417E11RikQ9CR05 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
4931417E11RikQ9CR05 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
4931417E11RikQ9CR05 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
4931417E11RikQ9CR05 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
4931417E11RikQ9CR05 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
4931417E11RikQ9CR05 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
4931417E11RikQ9CR05 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
4931417E11RikQ9CR05 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
4931417E11RikQ9CR05 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
4931417E11RikQ9CR05 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
4931417E11RikQ9CR05 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms