Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQY1

Atg12, Ubiquitin-like protein ATG12, mousemouse

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Length 141 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg12Q9CQY1 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Atg12Q9CQY1 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atg12Q9CQY1 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atg12Q9CQY1 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atg12Q9CQY1 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atg12Q9CQY1 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atg12Q9CQY1 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atg12Q9CQY1 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atg12Q9CQY1 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atg12Q9CQY1 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Atg12Q9CQY1 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atg12Q9CQY1 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atg12Q9CQY1 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atg12Q9CQY1 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atg12Q9CQY1 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atg12Q9CQY1 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atg12Q9CQY1 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atg12Q9CQY1 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atg12Q9CQY1 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atg12Q9CQY1 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atg12Q9CQY1 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atg12Q9CQY1 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atg12Q9CQY1 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atg12Q9CQY1 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atg12Q9CQY1 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atg12Q9CQY1 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Atg12Q9CQY1 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atg12Q9CQY1 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atg12Q9CQY1 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atg12Q9CQY1 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atg12Q9CQY1 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atg12Q9CQY1 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atg12Q9CQY1 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atg12Q9CQY1 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atg12Q9CQY1 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atg12Q9CQY1 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atg12Q9CQY1 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atg12Q9CQY1 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atg12Q9CQY1 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atg12Q9CQY1 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atg12Q9CQY1 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atg12Q9CQY1 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atg12Q9CQY1 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atg12Q9CQY1 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atg12Q9CQY1 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Atg12Q9CQY1 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Atg12Q9CQY1 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Atg12Q9CQY1 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Atg12Q9CQY1 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Atg12Q9CQY1 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Atg12Q9CQY1 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Atg12Q9CQY1 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Atg12Q9CQY1 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Atg12Q9CQY1 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Atg12Q9CQY1 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Atg12Q9CQY1 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Atg12Q9CQY1 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Atg12Q9CQY1 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Atg12Q9CQY1 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Atg12Q9CQY1 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Atg12Q9CQY1 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Atg12Q9CQY1 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Atg12Q9CQY1 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Atg12Q9CQY1 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Atg12Q9CQY1 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Atg12Q9CQY1 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Atg12Q9CQY1 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Atg12Q9CQY1 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Atg12Q9CQY1 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Atg12Q9CQY1 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Atg12Q9CQY1 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atg12Q9CQY1 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atg12Q9CQY1 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atg12Q9CQY1 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atg12Q9CQY1 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atg12Q9CQY1 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atg12Q9CQY1 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atg12Q9CQY1 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Atg12Q9CQY1 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atg12Q9CQY1 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atg12Q9CQY1 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atg12Q9CQY1 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atg12Q9CQY1 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atg12Q9CQY1 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atg12Q9CQY1 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Atg12Q9CQY1 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Atg12Q9CQY1 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Atg12Q9CQY1 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Atg12Q9CQY1 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Atg12Q9CQY1 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Atg12Q9CQY1 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Atg12Q9CQY1 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Atg12Q9CQY1 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Atg12Q9CQY1 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Atg12Q9CQY1 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Atg12Q9CQY1 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Atg12Q9CQY1 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Atg12Q9CQY1 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Atg12Q9CQY1 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Atg12Q9CQY1 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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