Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ7

Atp5f1, ATP synthase F(0) complex subunit B1, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5f1Q9CQQ7 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp5f1Q9CQQ7 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp5f1Q9CQQ7 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp5f1Q9CQQ7 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp5f1Q9CQQ7 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp5f1Q9CQQ7 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp5f1Q9CQQ7 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp5f1Q9CQQ7 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp5f1Q9CQQ7 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp5f1Q9CQQ7 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp5f1Q9CQQ7 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp5f1Q9CQQ7 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp5f1Q9CQQ7 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp5f1Q9CQQ7 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp5f1Q9CQQ7 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp5f1Q9CQQ7 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp5f1Q9CQQ7 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp5f1Q9CQQ7 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp5f1Q9CQQ7 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp5f1Q9CQQ7 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp5f1Q9CQQ7 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp5f1Q9CQQ7 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp5f1Q9CQQ7 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp5f1Q9CQQ7 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp5f1Q9CQQ7 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp5f1Q9CQQ7 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp5f1Q9CQQ7 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp5f1Q9CQQ7 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp5f1Q9CQQ7 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp5f1Q9CQQ7 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp5f1Q9CQQ7 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp5f1Q9CQQ7 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp5f1Q9CQQ7 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp5f1Q9CQQ7 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp5f1Q9CQQ7 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp5f1Q9CQQ7 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp5f1Q9CQQ7 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp5f1Q9CQQ7 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp5f1Q9CQQ7 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp5f1Q9CQQ7 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atp5f1Q9CQQ7 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atp5f1Q9CQQ7 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atp5f1Q9CQQ7 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atp5f1Q9CQQ7 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atp5f1Q9CQQ7 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atp5f1Q9CQQ7 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp5f1Q9CQQ7 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp5f1Q9CQQ7 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp5f1Q9CQQ7 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp5f1Q9CQQ7 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp5f1Q9CQQ7 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp5f1Q9CQQ7 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp5f1Q9CQQ7 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp5f1Q9CQQ7 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp5f1Q9CQQ7 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp5f1Q9CQQ7 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp5f1Q9CQQ7 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp5f1Q9CQQ7 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp5f1Q9CQQ7 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp5f1Q9CQQ7 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp5f1Q9CQQ7 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp5f1Q9CQQ7 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp5f1Q9CQQ7 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp5f1Q9CQQ7 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp5f1Q9CQQ7 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp5f1Q9CQQ7 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp5f1Q9CQQ7 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp5f1Q9CQQ7 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp5f1Q9CQQ7 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp5f1Q9CQQ7 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp5f1Q9CQQ7 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp5f1Q9CQQ7 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp5f1Q9CQQ7 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp5f1Q9CQQ7 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp5f1Q9CQQ7 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp5f1Q9CQQ7 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp5f1Q9CQQ7 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp5f1Q9CQQ7 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp5f1Q9CQQ7 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp5f1Q9CQQ7 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp5f1Q9CQQ7 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp5f1Q9CQQ7 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp5f1Q9CQQ7 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp5f1Q9CQQ7 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp5f1Q9CQQ7 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp5f1Q9CQQ7 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp5f1Q9CQQ7 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp5f1Q9CQQ7 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp5f1Q9CQQ7 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp5f1Q9CQQ7 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp5f1Q9CQQ7 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp5f1Q9CQQ7 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp5f1Q9CQQ7 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp5f1Q9CQQ7 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp5f1Q9CQQ7 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp5f1Q9CQQ7 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp5f1Q9CQQ7 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp5f1Q9CQQ7 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp5f1Q9CQQ7 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp5f1Q9CQQ7 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms