Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQK7

Rwdd1, RWD domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rwdd1Q9CQK7 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rwdd1Q9CQK7 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rwdd1Q9CQK7 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rwdd1Q9CQK7 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rwdd1Q9CQK7 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rwdd1Q9CQK7 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rwdd1Q9CQK7 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rwdd1Q9CQK7 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rwdd1Q9CQK7 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rwdd1Q9CQK7 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rwdd1Q9CQK7 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rwdd1Q9CQK7 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rwdd1Q9CQK7 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rwdd1Q9CQK7 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rwdd1Q9CQK7 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rwdd1Q9CQK7 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rwdd1Q9CQK7 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rwdd1Q9CQK7 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rwdd1Q9CQK7 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rwdd1Q9CQK7 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rwdd1Q9CQK7 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rwdd1Q9CQK7 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rwdd1Q9CQK7 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rwdd1Q9CQK7 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rwdd1Q9CQK7 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rwdd1Q9CQK7 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rwdd1Q9CQK7 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rwdd1Q9CQK7 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rwdd1Q9CQK7 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rwdd1Q9CQK7 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Rwdd1Q9CQK7 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Rwdd1Q9CQK7 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Rwdd1Q9CQK7 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rwdd1Q9CQK7 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rwdd1Q9CQK7 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rwdd1Q9CQK7 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rwdd1Q9CQK7 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rwdd1Q9CQK7 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rwdd1Q9CQK7 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rwdd1Q9CQK7 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rwdd1Q9CQK7 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rwdd1Q9CQK7 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rwdd1Q9CQK7 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rwdd1Q9CQK7 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rwdd1Q9CQK7 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rwdd1Q9CQK7 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rwdd1Q9CQK7 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rwdd1Q9CQK7 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rwdd1Q9CQK7 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rwdd1Q9CQK7 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Rwdd1Q9CQK7 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Rwdd1Q9CQK7 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rwdd1Q9CQK7 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rwdd1Q9CQK7 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rwdd1Q9CQK7 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rwdd1Q9CQK7 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rwdd1Q9CQK7 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rwdd1Q9CQK7 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rwdd1Q9CQK7 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rwdd1Q9CQK7 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rwdd1Q9CQK7 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rwdd1Q9CQK7 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rwdd1Q9CQK7 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rwdd1Q9CQK7 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rwdd1Q9CQK7 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rwdd1Q9CQK7 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rwdd1Q9CQK7 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Rwdd1Q9CQK7 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rwdd1Q9CQK7 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rwdd1Q9CQK7 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rwdd1Q9CQK7 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rwdd1Q9CQK7 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rwdd1Q9CQK7 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rwdd1Q9CQK7 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Rwdd1Q9CQK7 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rwdd1Q9CQK7 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rwdd1Q9CQK7 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rwdd1Q9CQK7 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rwdd1Q9CQK7 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rwdd1Q9CQK7 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rwdd1Q9CQK7 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rwdd1Q9CQK7 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rwdd1Q9CQK7 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rwdd1Q9CQK7 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rwdd1Q9CQK7 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rwdd1Q9CQK7 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Rwdd1Q9CQK7 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rwdd1Q9CQK7 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rwdd1Q9CQK7 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rwdd1Q9CQK7 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rwdd1Q9CQK7 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rwdd1Q9CQK7 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rwdd1Q9CQK7 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Rwdd1Q9CQK7 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rwdd1Q9CQK7 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rwdd1Q9CQK7 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rwdd1Q9CQK7 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rwdd1Q9CQK7 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rwdd1Q9CQK7 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rwdd1Q9CQK7 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms