Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQK3

Rdm1, RAD52 motif-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdm1Q9CQK3 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rdm1Q9CQK3 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rdm1Q9CQK3 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rdm1Q9CQK3 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rdm1Q9CQK3 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Rdm1Q9CQK3 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rdm1Q9CQK3 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rdm1Q9CQK3 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rdm1Q9CQK3 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rdm1Q9CQK3 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rdm1Q9CQK3 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rdm1Q9CQK3 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rdm1Q9CQK3 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rdm1Q9CQK3 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rdm1Q9CQK3 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rdm1Q9CQK3 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rdm1Q9CQK3 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rdm1Q9CQK3 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rdm1Q9CQK3 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rdm1Q9CQK3 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Rdm1Q9CQK3 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rdm1Q9CQK3 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rdm1Q9CQK3 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rdm1Q9CQK3 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rdm1Q9CQK3 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rdm1Q9CQK3 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Rdm1Q9CQK3 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rdm1Q9CQK3 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rdm1Q9CQK3 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rdm1Q9CQK3 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rdm1Q9CQK3 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rdm1Q9CQK3 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Rdm1Q9CQK3 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Rdm1Q9CQK3 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rdm1Q9CQK3 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Rdm1Q9CQK3 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Rdm1Q9CQK3 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Rdm1Q9CQK3 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rdm1Q9CQK3 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rdm1Q9CQK3 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rdm1Q9CQK3 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rdm1Q9CQK3 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rdm1Q9CQK3 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rdm1Q9CQK3 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rdm1Q9CQK3 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rdm1Q9CQK3 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rdm1Q9CQK3 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rdm1Q9CQK3 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rdm1Q9CQK3 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Rdm1Q9CQK3 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rdm1Q9CQK3 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rdm1Q9CQK3 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rdm1Q9CQK3 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rdm1Q9CQK3 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rdm1Q9CQK3 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rdm1Q9CQK3 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rdm1Q9CQK3 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rdm1Q9CQK3 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rdm1Q9CQK3 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rdm1Q9CQK3 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rdm1Q9CQK3 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rdm1Q9CQK3 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rdm1Q9CQK3 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rdm1Q9CQK3 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Rdm1Q9CQK3 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Rdm1Q9CQK3 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rdm1Q9CQK3 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rdm1Q9CQK3 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rdm1Q9CQK3 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rdm1Q9CQK3 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rdm1Q9CQK3 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rdm1Q9CQK3 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rdm1Q9CQK3 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rdm1Q9CQK3 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rdm1Q9CQK3 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rdm1Q9CQK3 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rdm1Q9CQK3 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Rdm1Q9CQK3 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rdm1Q9CQK3 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rdm1Q9CQK3 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rdm1Q9CQK3 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rdm1Q9CQK3 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rdm1Q9CQK3 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rdm1Q9CQK3 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rdm1Q9CQK3 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rdm1Q9CQK3 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Rdm1Q9CQK3 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rdm1Q9CQK3 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rdm1Q9CQK3 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Rdm1Q9CQK3 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rdm1Q9CQK3 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rdm1Q9CQK3 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rdm1Q9CQK3 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rdm1Q9CQK3 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rdm1Q9CQK3 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rdm1Q9CQK3 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rdm1Q9CQK3 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rdm1Q9CQK3 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rdm1Q9CQK3 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rdm1Q9CQK3 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms