Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ6

Denr, Density-regulated protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DenrQ9CQJ6 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DenrQ9CQJ6 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DenrQ9CQJ6 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DenrQ9CQJ6 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DenrQ9CQJ6 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DenrQ9CQJ6 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DenrQ9CQJ6 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DenrQ9CQJ6 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DenrQ9CQJ6 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DenrQ9CQJ6 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
DenrQ9CQJ6 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DenrQ9CQJ6 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DenrQ9CQJ6 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DenrQ9CQJ6 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DenrQ9CQJ6 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DenrQ9CQJ6 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
DenrQ9CQJ6 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
DenrQ9CQJ6 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DenrQ9CQJ6 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DenrQ9CQJ6 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
DenrQ9CQJ6 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
DenrQ9CQJ6 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DenrQ9CQJ6 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DenrQ9CQJ6 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
DenrQ9CQJ6 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DenrQ9CQJ6 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DenrQ9CQJ6 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DenrQ9CQJ6 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DenrQ9CQJ6 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DenrQ9CQJ6 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DenrQ9CQJ6 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DenrQ9CQJ6 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DenrQ9CQJ6 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DenrQ9CQJ6 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DenrQ9CQJ6 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DenrQ9CQJ6 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DenrQ9CQJ6 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DenrQ9CQJ6 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DenrQ9CQJ6 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DenrQ9CQJ6 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DenrQ9CQJ6 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DenrQ9CQJ6 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DenrQ9CQJ6 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DenrQ9CQJ6 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DenrQ9CQJ6 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DenrQ9CQJ6 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DenrQ9CQJ6 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DenrQ9CQJ6 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DenrQ9CQJ6 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DenrQ9CQJ6 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DenrQ9CQJ6 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DenrQ9CQJ6 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DenrQ9CQJ6 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DenrQ9CQJ6 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DenrQ9CQJ6 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DenrQ9CQJ6 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DenrQ9CQJ6 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DenrQ9CQJ6 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DenrQ9CQJ6 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DenrQ9CQJ6 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DenrQ9CQJ6 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DenrQ9CQJ6 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DenrQ9CQJ6 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DenrQ9CQJ6 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DenrQ9CQJ6 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DenrQ9CQJ6 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DenrQ9CQJ6 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DenrQ9CQJ6 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DenrQ9CQJ6 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
DenrQ9CQJ6 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DenrQ9CQJ6 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DenrQ9CQJ6 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DenrQ9CQJ6 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DenrQ9CQJ6 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DenrQ9CQJ6 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DenrQ9CQJ6 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DenrQ9CQJ6 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DenrQ9CQJ6 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DenrQ9CQJ6 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DenrQ9CQJ6 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DenrQ9CQJ6 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DenrQ9CQJ6 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DenrQ9CQJ6 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DenrQ9CQJ6 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DenrQ9CQJ6 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DenrQ9CQJ6 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DenrQ9CQJ6 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DenrQ9CQJ6 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DenrQ9CQJ6 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DenrQ9CQJ6 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DenrQ9CQJ6 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DenrQ9CQJ6 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
DenrQ9CQJ6 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DenrQ9CQJ6 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DenrQ9CQJ6 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DenrQ9CQJ6 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DenrQ9CQJ6 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DenrQ9CQJ6 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DenrQ9CQJ6 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DenrQ9CQJ6 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms