Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE1

Nipsnap3b, Protein NipSnap homolog 3B, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nipsnap3bQ9CQE1 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nipsnap3bQ9CQE1 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nipsnap3bQ9CQE1 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nipsnap3bQ9CQE1 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nipsnap3bQ9CQE1 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nipsnap3bQ9CQE1 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nipsnap3bQ9CQE1 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nipsnap3bQ9CQE1 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Nipsnap3bQ9CQE1 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Nipsnap3bQ9CQE1 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Nipsnap3bQ9CQE1 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Nipsnap3bQ9CQE1 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Nipsnap3bQ9CQE1 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Nipsnap3bQ9CQE1 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nipsnap3bQ9CQE1 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nipsnap3bQ9CQE1 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nipsnap3bQ9CQE1 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nipsnap3bQ9CQE1 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nipsnap3bQ9CQE1 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nipsnap3bQ9CQE1 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nipsnap3bQ9CQE1 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nipsnap3bQ9CQE1 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nipsnap3bQ9CQE1 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nipsnap3bQ9CQE1 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nipsnap3bQ9CQE1 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nipsnap3bQ9CQE1 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nipsnap3bQ9CQE1 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nipsnap3bQ9CQE1 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nipsnap3bQ9CQE1 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nipsnap3bQ9CQE1 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nipsnap3bQ9CQE1 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nipsnap3bQ9CQE1 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nipsnap3bQ9CQE1 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Nipsnap3bQ9CQE1 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nipsnap3bQ9CQE1 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nipsnap3bQ9CQE1 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nipsnap3bQ9CQE1 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nipsnap3bQ9CQE1 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nipsnap3bQ9CQE1 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Nipsnap3bQ9CQE1 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nipsnap3bQ9CQE1 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nipsnap3bQ9CQE1 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nipsnap3bQ9CQE1 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nipsnap3bQ9CQE1 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nipsnap3bQ9CQE1 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nipsnap3bQ9CQE1 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nipsnap3bQ9CQE1 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nipsnap3bQ9CQE1 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Nipsnap3bQ9CQE1 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nipsnap3bQ9CQE1 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nipsnap3bQ9CQE1 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nipsnap3bQ9CQE1 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nipsnap3bQ9CQE1 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nipsnap3bQ9CQE1 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Nipsnap3bQ9CQE1 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nipsnap3bQ9CQE1 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nipsnap3bQ9CQE1 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nipsnap3bQ9CQE1 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nipsnap3bQ9CQE1 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nipsnap3bQ9CQE1 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nipsnap3bQ9CQE1 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nipsnap3bQ9CQE1 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nipsnap3bQ9CQE1 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nipsnap3bQ9CQE1 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Nipsnap3bQ9CQE1 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nipsnap3bQ9CQE1 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nipsnap3bQ9CQE1 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nipsnap3bQ9CQE1 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nipsnap3bQ9CQE1 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nipsnap3bQ9CQE1 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nipsnap3bQ9CQE1 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nipsnap3bQ9CQE1 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nipsnap3bQ9CQE1 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nipsnap3bQ9CQE1 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nipsnap3bQ9CQE1 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nipsnap3bQ9CQE1 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nipsnap3bQ9CQE1 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nipsnap3bQ9CQE1 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nipsnap3bQ9CQE1 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nipsnap3bQ9CQE1 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nipsnap3bQ9CQE1 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nipsnap3bQ9CQE1 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nipsnap3bQ9CQE1 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nipsnap3bQ9CQE1 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nipsnap3bQ9CQE1 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nipsnap3bQ9CQE1 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nipsnap3bQ9CQE1 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nipsnap3bQ9CQE1 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms