Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQC3

Protein C9orf135 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQC3 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q9CQC3 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q9CQC3 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q9CQC3 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q9CQC3 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q9CQC3 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q9CQC3 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q9CQC3 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Q9CQC3 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q9CQC3 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q9CQC3 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q9CQC3 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q9CQC3 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q9CQC3 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q9CQC3 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q9CQC3 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q9CQC3 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q9CQC3 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q9CQC3 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q9CQC3 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q9CQC3 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q9CQC3 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q9CQC3 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q9CQC3 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q9CQC3 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q9CQC3 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q9CQC3 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Q9CQC3 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q9CQC3 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q9CQC3 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q9CQC3 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q9CQC3 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q9CQC3 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q9CQC3 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q9CQC3 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q9CQC3 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q9CQC3 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Q9CQC3 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q9CQC3 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q9CQC3 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q9CQC3 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q9CQC3 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q9CQC3 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q9CQC3 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q9CQC3 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q9CQC3 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Q9CQC3 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q9CQC3 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q9CQC3 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q9CQC3 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q9CQC3 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q9CQC3 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q9CQC3 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Q9CQC3 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q9CQC3 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q9CQC3 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q9CQC3 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q9CQC3 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q9CQC3 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q9CQC3 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q9CQC3 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q9CQC3 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Q9CQC3 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q9CQC3 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q9CQC3 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q9CQC3 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q9CQC3 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q9CQC3 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q9CQC3 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q9CQC3 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q9CQC3 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q9CQC3 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Q9CQC3 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Q9CQC3 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Q9CQC3 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Q9CQC3 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Q9CQC3 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Q9CQC3 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Q9CQC3 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Q9CQC3 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Q9CQC3 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Q9CQC3 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Q9CQC3 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Q9CQC3 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Q9CQC3 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Q9CQC3 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Q9CQC3 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Q9CQC3 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Q9CQC3 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Q9CQC3 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q9CQC3 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Q9CQC3 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q9CQC3 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q9CQC3 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q9CQC3 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q9CQC3 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q9CQC3 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q9CQC3 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q9CQC3 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q9CQC3 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms