Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atg3Q9CPX6 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atg3Q9CPX6 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atg3Q9CPX6 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atg3Q9CPX6 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atg3Q9CPX6 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atg3Q9CPX6 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atg3Q9CPX6 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atg3Q9CPX6 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Atg3Q9CPX6 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Atg3Q9CPX6 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Atg3Q9CPX6 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Atg3Q9CPX6 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Atg3Q9CPX6 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Atg3Q9CPX6 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Atg3Q9CPX6 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Atg3Q9CPX6 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Atg3Q9CPX6 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Atg3Q9CPX6 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atg3Q9CPX6 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atg3Q9CPX6 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atg3Q9CPX6 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atg3Q9CPX6 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atg3Q9CPX6 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atg3Q9CPX6 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atg3Q9CPX6 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atg3Q9CPX6 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atg3Q9CPX6 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atg3Q9CPX6 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Atg3Q9CPX6 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atg3Q9CPX6 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atg3Q9CPX6 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atg3Q9CPX6 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atg3Q9CPX6 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atg3Q9CPX6 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atg3Q9CPX6 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atg3Q9CPX6 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atg3Q9CPX6 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atg3Q9CPX6 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atg3Q9CPX6 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atg3Q9CPX6 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atg3Q9CPX6 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atg3Q9CPX6 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atg3Q9CPX6 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atg3Q9CPX6 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atg3Q9CPX6 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atg3Q9CPX6 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atg3Q9CPX6 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atg3Q9CPX6 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atg3Q9CPX6 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atg3Q9CPX6 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Atg3Q9CPX6 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atg3Q9CPX6 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atg3Q9CPX6 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atg3Q9CPX6 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atg3Q9CPX6 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atg3Q9CPX6 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atg3Q9CPX6 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atg3Q9CPX6 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atg3Q9CPX6 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atg3Q9CPX6 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atg3Q9CPX6 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atg3Q9CPX6 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atg3Q9CPX6 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atg3Q9CPX6 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atg3Q9CPX6 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atg3Q9CPX6 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atg3Q9CPX6 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atg3Q9CPX6 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atg3Q9CPX6 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atg3Q9CPX6 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atg3Q9CPX6 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atg3Q9CPX6 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atg3Q9CPX6 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atg3Q9CPX6 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Atg3Q9CPX6 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atg3Q9CPX6 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atg3Q9CPX6 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atg3Q9CPX6 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atg3Q9CPX6 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atg3Q9CPX6 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atg3Q9CPX6 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atg3Q9CPX6 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atg3Q9CPX6 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atg3Q9CPX6 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atg3Q9CPX6 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Atg3Q9CPX6 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atg3Q9CPX6 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atg3Q9CPX6 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atg3Q9CPX6 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atg3Q9CPX6 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Atg3Q9CPX6 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atg3Q9CPX6 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atg3Q9CPX6 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atg3Q9CPX6 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atg3Q9CPX6 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atg3Q9CPX6 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atg3Q9CPX6 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atg3Q9CPX6 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atg3Q9CPX6 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.8 ms