Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPS7

Pno1, RNA-binding protein PNO1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pno1Q9CPS7 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pno1Q9CPS7 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pno1Q9CPS7 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pno1Q9CPS7 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pno1Q9CPS7 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pno1Q9CPS7 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pno1Q9CPS7 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pno1Q9CPS7 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pno1Q9CPS7 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Pno1Q9CPS7 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pno1Q9CPS7 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pno1Q9CPS7 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pno1Q9CPS7 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Pno1Q9CPS7 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pno1Q9CPS7 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pno1Q9CPS7 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Pno1Q9CPS7 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Pno1Q9CPS7 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pno1Q9CPS7 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pno1Q9CPS7 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pno1Q9CPS7 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pno1Q9CPS7 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pno1Q9CPS7 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pno1Q9CPS7 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pno1Q9CPS7 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pno1Q9CPS7 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pno1Q9CPS7 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pno1Q9CPS7 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pno1Q9CPS7 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pno1Q9CPS7 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pno1Q9CPS7 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pno1Q9CPS7 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pno1Q9CPS7 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pno1Q9CPS7 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Pno1Q9CPS7 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pno1Q9CPS7 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pno1Q9CPS7 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pno1Q9CPS7 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Pno1Q9CPS7 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Pno1Q9CPS7 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pno1Q9CPS7 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Pno1Q9CPS7 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pno1Q9CPS7 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pno1Q9CPS7 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pno1Q9CPS7 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Pno1Q9CPS7 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pno1Q9CPS7 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pno1Q9CPS7 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pno1Q9CPS7 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pno1Q9CPS7 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pno1Q9CPS7 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pno1Q9CPS7 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pno1Q9CPS7 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pno1Q9CPS7 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pno1Q9CPS7 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pno1Q9CPS7 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pno1Q9CPS7 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pno1Q9CPS7 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pno1Q9CPS7 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pno1Q9CPS7 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pno1Q9CPS7 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pno1Q9CPS7 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pno1Q9CPS7 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pno1Q9CPS7 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pno1Q9CPS7 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pno1Q9CPS7 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pno1Q9CPS7 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pno1Q9CPS7 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pno1Q9CPS7 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pno1Q9CPS7 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pno1Q9CPS7 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pno1Q9CPS7 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pno1Q9CPS7 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pno1Q9CPS7 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pno1Q9CPS7 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pno1Q9CPS7 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pno1Q9CPS7 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pno1Q9CPS7 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pno1Q9CPS7 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pno1Q9CPS7 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pno1Q9CPS7 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pno1Q9CPS7 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pno1Q9CPS7 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pno1Q9CPS7 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pno1Q9CPS7 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pno1Q9CPS7 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pno1Q9CPS7 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pno1Q9CPS7 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pno1Q9CPS7 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pno1Q9CPS7 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pno1Q9CPS7 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pno1Q9CPS7 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Pno1Q9CPS7 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pno1Q9CPS7 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pno1Q9CPS7 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pno1Q9CPS7 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pno1Q9CPS7 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pno1Q9CPS7 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pno1Q9CPS7 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pno1Q9CPS7 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms