Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR6

Krt88, Keratin 88, mousemouse

Predictions only

Length 171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt88Q9CPR6 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt88Q9CPR6 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt88Q9CPR6 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt88Q9CPR6 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt88Q9CPR6 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt88Q9CPR6 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt88Q9CPR6 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt88Q9CPR6 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt88Q9CPR6 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt88Q9CPR6 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt88Q9CPR6 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt88Q9CPR6 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt88Q9CPR6 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt88Q9CPR6 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt88Q9CPR6 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt88Q9CPR6 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt88Q9CPR6 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt88Q9CPR6 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt88Q9CPR6 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt88Q9CPR6 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt88Q9CPR6 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt88Q9CPR6 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt88Q9CPR6 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt88Q9CPR6 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt88Q9CPR6 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt88Q9CPR6 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt88Q9CPR6 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt88Q9CPR6 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt88Q9CPR6 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt88Q9CPR6 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt88Q9CPR6 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt88Q9CPR6 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt88Q9CPR6 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt88Q9CPR6 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt88Q9CPR6 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt88Q9CPR6 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt88Q9CPR6 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt88Q9CPR6 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt88Q9CPR6 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt88Q9CPR6 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt88Q9CPR6 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt88Q9CPR6 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt88Q9CPR6 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt88Q9CPR6 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt88Q9CPR6 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt88Q9CPR6 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt88Q9CPR6 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt88Q9CPR6 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt88Q9CPR6 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt88Q9CPR6 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt88Q9CPR6 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt88Q9CPR6 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt88Q9CPR6 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt88Q9CPR6 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt88Q9CPR6 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt88Q9CPR6 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt88Q9CPR6 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt88Q9CPR6 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt88Q9CPR6 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt88Q9CPR6 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt88Q9CPR6 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt88Q9CPR6 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Krt88Q9CPR6 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt88Q9CPR6 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt88Q9CPR6 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt88Q9CPR6 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt88Q9CPR6 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt88Q9CPR6 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt88Q9CPR6 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt88Q9CPR6 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt88Q9CPR6 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt88Q9CPR6 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt88Q9CPR6 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt88Q9CPR6 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt88Q9CPR6 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt88Q9CPR6 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt88Q9CPR6 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt88Q9CPR6 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt88Q9CPR6 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt88Q9CPR6 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt88Q9CPR6 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt88Q9CPR6 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt88Q9CPR6 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt88Q9CPR6 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt88Q9CPR6 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt88Q9CPR6 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt88Q9CPR6 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt88Q9CPR6 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt88Q9CPR6 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt88Q9CPR6 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt88Q9CPR6 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt88Q9CPR6 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt88Q9CPR6 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt88Q9CPR6 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt88Q9CPR6 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt88Q9CPR6 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt88Q9CPR6 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt88Q9CPR6 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt88Q9CPR6 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt88Q9CPR6 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms