Protein–RNA interactions for Protein: Q99PL5

Rrbp1, Ribosome-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrbp1Q99PL5 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rrbp1Q99PL5 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rrbp1Q99PL5 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Rrbp1Q99PL5 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Rrbp1Q99PL5 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Rrbp1Q99PL5 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rrbp1Q99PL5 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Rrbp1Q99PL5 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Rrbp1Q99PL5 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rrbp1Q99PL5 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Rrbp1Q99PL5 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rrbp1Q99PL5 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rrbp1Q99PL5 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rrbp1Q99PL5 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rrbp1Q99PL5 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rrbp1Q99PL5 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Rrbp1Q99PL5 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rrbp1Q99PL5 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rrbp1Q99PL5 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rrbp1Q99PL5 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rrbp1Q99PL5 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rrbp1Q99PL5 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rrbp1Q99PL5 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rrbp1Q99PL5 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rrbp1Q99PL5 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rrbp1Q99PL5 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rrbp1Q99PL5 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rrbp1Q99PL5 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rrbp1Q99PL5 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rrbp1Q99PL5 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rrbp1Q99PL5 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rrbp1Q99PL5 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rrbp1Q99PL5 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Rrbp1Q99PL5 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Rrbp1Q99PL5 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rrbp1Q99PL5 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rrbp1Q99PL5 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rrbp1Q99PL5 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Rrbp1Q99PL5 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rrbp1Q99PL5 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rrbp1Q99PL5 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rrbp1Q99PL5 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rrbp1Q99PL5 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rrbp1Q99PL5 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rrbp1Q99PL5 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rrbp1Q99PL5 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rrbp1Q99PL5 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rrbp1Q99PL5 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rrbp1Q99PL5 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rrbp1Q99PL5 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rrbp1Q99PL5 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rrbp1Q99PL5 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Rrbp1Q99PL5 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Rrbp1Q99PL5 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Rrbp1Q99PL5 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Rrbp1Q99PL5 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Rrbp1Q99PL5 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Rrbp1Q99PL5 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Rrbp1Q99PL5 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Rrbp1Q99PL5 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Rrbp1Q99PL5 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Rrbp1Q99PL5 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Rrbp1Q99PL5 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Rrbp1Q99PL5 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Rrbp1Q99PL5 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
Rrbp1Q99PL5 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Rrbp1Q99PL5 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Rrbp1Q99PL5 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Rrbp1Q99PL5 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Rrbp1Q99PL5 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Rrbp1Q99PL5 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Rrbp1Q99PL5 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Rrbp1Q99PL5 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rrbp1Q99PL5 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Rrbp1Q99PL5 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rrbp1Q99PL5 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Rrbp1Q99PL5 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rrbp1Q99PL5 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rrbp1Q99PL5 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rrbp1Q99PL5 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rrbp1Q99PL5 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rrbp1Q99PL5 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rrbp1Q99PL5 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rrbp1Q99PL5 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rrbp1Q99PL5 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rrbp1Q99PL5 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rrbp1Q99PL5 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rrbp1Q99PL5 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rrbp1Q99PL5 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rrbp1Q99PL5 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rrbp1Q99PL5 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rrbp1Q99PL5 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Rrbp1Q99PL5 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rrbp1Q99PL5 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rrbp1Q99PL5 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Rrbp1Q99PL5 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rrbp1Q99PL5 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rrbp1Q99PL5 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rrbp1Q99PL5 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rrbp1Q99PL5 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms