Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF3

Cep41, Centrosomal protein of 41 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep41Q99NF3 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cep41Q99NF3 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cep41Q99NF3 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cep41Q99NF3 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cep41Q99NF3 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cep41Q99NF3 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cep41Q99NF3 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cep41Q99NF3 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cep41Q99NF3 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cep41Q99NF3 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cep41Q99NF3 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cep41Q99NF3 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cep41Q99NF3 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cep41Q99NF3 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cep41Q99NF3 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cep41Q99NF3 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cep41Q99NF3 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cep41Q99NF3 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cep41Q99NF3 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cep41Q99NF3 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cep41Q99NF3 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cep41Q99NF3 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cep41Q99NF3 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cep41Q99NF3 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cep41Q99NF3 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cep41Q99NF3 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cep41Q99NF3 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cep41Q99NF3 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cep41Q99NF3 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cep41Q99NF3 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cep41Q99NF3 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cep41Q99NF3 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cep41Q99NF3 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cep41Q99NF3 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cep41Q99NF3 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cep41Q99NF3 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cep41Q99NF3 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cep41Q99NF3 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cep41Q99NF3 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cep41Q99NF3 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Cep41Q99NF3 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cep41Q99NF3 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cep41Q99NF3 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cep41Q99NF3 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cep41Q99NF3 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cep41Q99NF3 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cep41Q99NF3 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cep41Q99NF3 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Cep41Q99NF3 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cep41Q99NF3 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cep41Q99NF3 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cep41Q99NF3 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cep41Q99NF3 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cep41Q99NF3 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cep41Q99NF3 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cep41Q99NF3 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cep41Q99NF3 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cep41Q99NF3 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cep41Q99NF3 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cep41Q99NF3 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cep41Q99NF3 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cep41Q99NF3 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cep41Q99NF3 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cep41Q99NF3 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cep41Q99NF3 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cep41Q99NF3 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cep41Q99NF3 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cep41Q99NF3 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cep41Q99NF3 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cep41Q99NF3 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cep41Q99NF3 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cep41Q99NF3 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cep41Q99NF3 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cep41Q99NF3 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Cep41Q99NF3 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cep41Q99NF3 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cep41Q99NF3 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cep41Q99NF3 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cep41Q99NF3 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cep41Q99NF3 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cep41Q99NF3 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cep41Q99NF3 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cep41Q99NF3 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cep41Q99NF3 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cep41Q99NF3 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cep41Q99NF3 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cep41Q99NF3 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cep41Q99NF3 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cep41Q99NF3 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cep41Q99NF3 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cep41Q99NF3 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cep41Q99NF3 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Cep41Q99NF3 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cep41Q99NF3 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cep41Q99NF3 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cep41Q99NF3 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cep41Q99NF3 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cep41Q99NF3 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cep41Q99NF3 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Cep41Q99NF3 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.6 ms