Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB9

Sf3b1, Splicing factor 3B subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b1Q99NB9 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sf3b1Q99NB9 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sf3b1Q99NB9 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sf3b1Q99NB9 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sf3b1Q99NB9 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sf3b1Q99NB9 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sf3b1Q99NB9 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sf3b1Q99NB9 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sf3b1Q99NB9 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Sf3b1Q99NB9 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sf3b1Q99NB9 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sf3b1Q99NB9 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sf3b1Q99NB9 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sf3b1Q99NB9 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sf3b1Q99NB9 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sf3b1Q99NB9 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sf3b1Q99NB9 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sf3b1Q99NB9 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sf3b1Q99NB9 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sf3b1Q99NB9 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sf3b1Q99NB9 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sf3b1Q99NB9 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sf3b1Q99NB9 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sf3b1Q99NB9 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sf3b1Q99NB9 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Sf3b1Q99NB9 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sf3b1Q99NB9 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sf3b1Q99NB9 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sf3b1Q99NB9 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sf3b1Q99NB9 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sf3b1Q99NB9 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sf3b1Q99NB9 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sf3b1Q99NB9 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sf3b1Q99NB9 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sf3b1Q99NB9 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sf3b1Q99NB9 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sf3b1Q99NB9 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sf3b1Q99NB9 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sf3b1Q99NB9 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sf3b1Q99NB9 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sf3b1Q99NB9 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sf3b1Q99NB9 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sf3b1Q99NB9 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sf3b1Q99NB9 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sf3b1Q99NB9 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sf3b1Q99NB9 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sf3b1Q99NB9 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sf3b1Q99NB9 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sf3b1Q99NB9 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sf3b1Q99NB9 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sf3b1Q99NB9 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sf3b1Q99NB9 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sf3b1Q99NB9 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sf3b1Q99NB9 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Sf3b1Q99NB9 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sf3b1Q99NB9 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sf3b1Q99NB9 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sf3b1Q99NB9 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sf3b1Q99NB9 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sf3b1Q99NB9 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sf3b1Q99NB9 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sf3b1Q99NB9 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sf3b1Q99NB9 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sf3b1Q99NB9 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sf3b1Q99NB9 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sf3b1Q99NB9 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sf3b1Q99NB9 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sf3b1Q99NB9 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sf3b1Q99NB9 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sf3b1Q99NB9 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sf3b1Q99NB9 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sf3b1Q99NB9 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sf3b1Q99NB9 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sf3b1Q99NB9 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sf3b1Q99NB9 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sf3b1Q99NB9 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sf3b1Q99NB9 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sf3b1Q99NB9 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sf3b1Q99NB9 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sf3b1Q99NB9 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sf3b1Q99NB9 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sf3b1Q99NB9 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sf3b1Q99NB9 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sf3b1Q99NB9 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Sf3b1Q99NB9 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sf3b1Q99NB9 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sf3b1Q99NB9 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sf3b1Q99NB9 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sf3b1Q99NB9 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sf3b1Q99NB9 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sf3b1Q99NB9 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sf3b1Q99NB9 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sf3b1Q99NB9 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sf3b1Q99NB9 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sf3b1Q99NB9 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sf3b1Q99NB9 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sf3b1Q99NB9 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sf3b1Q99NB9 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sf3b1Q99NB9 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sf3b1Q99NB9 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms