Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB1

Acss1, Acetyl-coenzyme A synthetase 2-like, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 682 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acss1Q99NB1 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Acss1Q99NB1 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Acss1Q99NB1 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Acss1Q99NB1 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Acss1Q99NB1 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Acss1Q99NB1 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Acss1Q99NB1 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Acss1Q99NB1 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Acss1Q99NB1 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Acss1Q99NB1 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Acss1Q99NB1 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Acss1Q99NB1 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Acss1Q99NB1 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Acss1Q99NB1 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Acss1Q99NB1 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Acss1Q99NB1 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Acss1Q99NB1 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Acss1Q99NB1 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Acss1Q99NB1 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Acss1Q99NB1 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Acss1Q99NB1 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Acss1Q99NB1 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Acss1Q99NB1 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Acss1Q99NB1 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Acss1Q99NB1 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Acss1Q99NB1 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Acss1Q99NB1 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Acss1Q99NB1 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Acss1Q99NB1 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Acss1Q99NB1 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Acss1Q99NB1 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Acss1Q99NB1 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Acss1Q99NB1 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Acss1Q99NB1 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Acss1Q99NB1 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Acss1Q99NB1 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Acss1Q99NB1 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Acss1Q99NB1 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Acss1Q99NB1 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Acss1Q99NB1 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Acss1Q99NB1 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Acss1Q99NB1 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Acss1Q99NB1 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Acss1Q99NB1 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Acss1Q99NB1 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Acss1Q99NB1 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Acss1Q99NB1 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Acss1Q99NB1 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Acss1Q99NB1 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Acss1Q99NB1 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Acss1Q99NB1 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Acss1Q99NB1 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Acss1Q99NB1 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Acss1Q99NB1 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Acss1Q99NB1 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Acss1Q99NB1 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Acss1Q99NB1 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Acss1Q99NB1 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Acss1Q99NB1 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Acss1Q99NB1 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Acss1Q99NB1 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Acss1Q99NB1 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Acss1Q99NB1 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Acss1Q99NB1 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Acss1Q99NB1 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Acss1Q99NB1 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Acss1Q99NB1 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Acss1Q99NB1 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Acss1Q99NB1 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Acss1Q99NB1 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Acss1Q99NB1 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Acss1Q99NB1 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Acss1Q99NB1 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Acss1Q99NB1 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Acss1Q99NB1 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Acss1Q99NB1 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Acss1Q99NB1 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Acss1Q99NB1 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Acss1Q99NB1 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Acss1Q99NB1 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Acss1Q99NB1 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Acss1Q99NB1 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Acss1Q99NB1 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Acss1Q99NB1 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Acss1Q99NB1 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Acss1Q99NB1 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Acss1Q99NB1 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Acss1Q99NB1 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Acss1Q99NB1 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Acss1Q99NB1 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Acss1Q99NB1 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Acss1Q99NB1 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Acss1Q99NB1 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Acss1Q99NB1 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Acss1Q99NB1 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Acss1Q99NB1 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Acss1Q99NB1 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Acss1Q99NB1 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Acss1Q99NB1 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Acss1Q99NB1 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms