Protein–RNA interactions for Protein: Q99M87

Dnaja3, DnaJ homolog subfamily A member 3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnaja3Q99M87 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Dnaja3Q99M87 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Dnaja3Q99M87 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dnaja3Q99M87 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dnaja3Q99M87 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dnaja3Q99M87 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Dnaja3Q99M87 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Dnaja3Q99M87 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dnaja3Q99M87 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dnaja3Q99M87 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dnaja3Q99M87 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dnaja3Q99M87 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Dnaja3Q99M87 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Dnaja3Q99M87 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Dnaja3Q99M87 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dnaja3Q99M87 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dnaja3Q99M87 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Dnaja3Q99M87 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Dnaja3Q99M87 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Dnaja3Q99M87 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dnaja3Q99M87 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dnaja3Q99M87 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dnaja3Q99M87 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Dnaja3Q99M87 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Dnaja3Q99M87 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Dnaja3Q99M87 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dnaja3Q99M87 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dnaja3Q99M87 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dnaja3Q99M87 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dnaja3Q99M87 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dnaja3Q99M87 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dnaja3Q99M87 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dnaja3Q99M87 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dnaja3Q99M87 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dnaja3Q99M87 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dnaja3Q99M87 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dnaja3Q99M87 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Dnaja3Q99M87 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dnaja3Q99M87 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dnaja3Q99M87 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dnaja3Q99M87 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dnaja3Q99M87 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dnaja3Q99M87 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Dnaja3Q99M87 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Dnaja3Q99M87 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dnaja3Q99M87 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dnaja3Q99M87 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Dnaja3Q99M87 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Dnaja3Q99M87 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dnaja3Q99M87 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Dnaja3Q99M87 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dnaja3Q99M87 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dnaja3Q99M87 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dnaja3Q99M87 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dnaja3Q99M87 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dnaja3Q99M87 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dnaja3Q99M87 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dnaja3Q99M87 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Dnaja3Q99M87 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Dnaja3Q99M87 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Dnaja3Q99M87 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Dnaja3Q99M87 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Dnaja3Q99M87 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Dnaja3Q99M87 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Dnaja3Q99M87 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Dnaja3Q99M87 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Dnaja3Q99M87 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dnaja3Q99M87 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dnaja3Q99M87 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dnaja3Q99M87 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dnaja3Q99M87 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Dnaja3Q99M87 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Dnaja3Q99M87 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Dnaja3Q99M87 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Dnaja3Q99M87 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Dnaja3Q99M87 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dnaja3Q99M87 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dnaja3Q99M87 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Dnaja3Q99M87 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Dnaja3Q99M87 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Dnaja3Q99M87 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dnaja3Q99M87 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dnaja3Q99M87 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Dnaja3Q99M87 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dnaja3Q99M87 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dnaja3Q99M87 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Dnaja3Q99M87 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Dnaja3Q99M87 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dnaja3Q99M87 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dnaja3Q99M87 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Dnaja3Q99M87 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dnaja3Q99M87 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Dnaja3Q99M87 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Dnaja3Q99M87 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dnaja3Q99M87 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dnaja3Q99M87 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dnaja3Q99M87 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dnaja3Q99M87 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dnaja3Q99M87 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dnaja3Q99M87 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms