Protein–RNA interactions for Protein: Q99LU0

Chmp1b1, Charged multivesicular body protein 1b-1, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp1b1Q99LU0 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chmp1b1Q99LU0 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chmp1b1Q99LU0 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chmp1b1Q99LU0 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chmp1b1Q99LU0 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chmp1b1Q99LU0 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chmp1b1Q99LU0 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chmp1b1Q99LU0 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chmp1b1Q99LU0 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chmp1b1Q99LU0 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Chmp1b1Q99LU0 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chmp1b1Q99LU0 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chmp1b1Q99LU0 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chmp1b1Q99LU0 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Chmp1b1Q99LU0 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chmp1b1Q99LU0 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chmp1b1Q99LU0 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chmp1b1Q99LU0 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chmp1b1Q99LU0 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chmp1b1Q99LU0 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chmp1b1Q99LU0 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chmp1b1Q99LU0 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chmp1b1Q99LU0 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chmp1b1Q99LU0 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chmp1b1Q99LU0 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chmp1b1Q99LU0 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chmp1b1Q99LU0 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chmp1b1Q99LU0 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chmp1b1Q99LU0 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chmp1b1Q99LU0 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chmp1b1Q99LU0 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chmp1b1Q99LU0 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chmp1b1Q99LU0 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chmp1b1Q99LU0 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chmp1b1Q99LU0 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chmp1b1Q99LU0 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Chmp1b1Q99LU0 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chmp1b1Q99LU0 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chmp1b1Q99LU0 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chmp1b1Q99LU0 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chmp1b1Q99LU0 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chmp1b1Q99LU0 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chmp1b1Q99LU0 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chmp1b1Q99LU0 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chmp1b1Q99LU0 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chmp1b1Q99LU0 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chmp1b1Q99LU0 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chmp1b1Q99LU0 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chmp1b1Q99LU0 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chmp1b1Q99LU0 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chmp1b1Q99LU0 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chmp1b1Q99LU0 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chmp1b1Q99LU0 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chmp1b1Q99LU0 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chmp1b1Q99LU0 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chmp1b1Q99LU0 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chmp1b1Q99LU0 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chmp1b1Q99LU0 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chmp1b1Q99LU0 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chmp1b1Q99LU0 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chmp1b1Q99LU0 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chmp1b1Q99LU0 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chmp1b1Q99LU0 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chmp1b1Q99LU0 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chmp1b1Q99LU0 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chmp1b1Q99LU0 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chmp1b1Q99LU0 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chmp1b1Q99LU0 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chmp1b1Q99LU0 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chmp1b1Q99LU0 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chmp1b1Q99LU0 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chmp1b1Q99LU0 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chmp1b1Q99LU0 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chmp1b1Q99LU0 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chmp1b1Q99LU0 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chmp1b1Q99LU0 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chmp1b1Q99LU0 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chmp1b1Q99LU0 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chmp1b1Q99LU0 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chmp1b1Q99LU0 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chmp1b1Q99LU0 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chmp1b1Q99LU0 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chmp1b1Q99LU0 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Chmp1b1Q99LU0 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chmp1b1Q99LU0 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chmp1b1Q99LU0 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chmp1b1Q99LU0 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chmp1b1Q99LU0 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chmp1b1Q99LU0 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chmp1b1Q99LU0 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chmp1b1Q99LU0 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chmp1b1Q99LU0 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chmp1b1Q99LU0 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chmp1b1Q99LU0 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Chmp1b1Q99LU0 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Chmp1b1Q99LU0 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Chmp1b1Q99LU0 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Chmp1b1Q99LU0 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Chmp1b1Q99LU0 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Chmp1b1Q99LU0 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms