Protein–RNA interactions for Protein: Q99LL3

Chst12, Carbohydrate sulfotransferase 12, mousemouse

Predictions only

Length 419 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chst12Q99LL3 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Chst12Q99LL3 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Chst12Q99LL3 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Chst12Q99LL3 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Chst12Q99LL3 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Chst12Q99LL3 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Chst12Q99LL3 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Chst12Q99LL3 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Chst12Q99LL3 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Chst12Q99LL3 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Chst12Q99LL3 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Chst12Q99LL3 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Chst12Q99LL3 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Chst12Q99LL3 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Chst12Q99LL3 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Chst12Q99LL3 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Chst12Q99LL3 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Chst12Q99LL3 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Chst12Q99LL3 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Chst12Q99LL3 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Chst12Q99LL3 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Chst12Q99LL3 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Chst12Q99LL3 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Chst12Q99LL3 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Chst12Q99LL3 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Chst12Q99LL3 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Chst12Q99LL3 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Chst12Q99LL3 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Chst12Q99LL3 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Chst12Q99LL3 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Chst12Q99LL3 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Chst12Q99LL3 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Chst12Q99LL3 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Chst12Q99LL3 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Chst12Q99LL3 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Chst12Q99LL3 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Chst12Q99LL3 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Chst12Q99LL3 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Chst12Q99LL3 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Chst12Q99LL3 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Chst12Q99LL3 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Chst12Q99LL3 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Chst12Q99LL3 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Chst12Q99LL3 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Chst12Q99LL3 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Chst12Q99LL3 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Chst12Q99LL3 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Chst12Q99LL3 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Chst12Q99LL3 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Chst12Q99LL3 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Chst12Q99LL3 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Chst12Q99LL3 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Chst12Q99LL3 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Chst12Q99LL3 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Chst12Q99LL3 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Chst12Q99LL3 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Chst12Q99LL3 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Chst12Q99LL3 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Chst12Q99LL3 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Chst12Q99LL3 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Chst12Q99LL3 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Chst12Q99LL3 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Chst12Q99LL3 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Chst12Q99LL3 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Chst12Q99LL3 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Chst12Q99LL3 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Chst12Q99LL3 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Chst12Q99LL3 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Chst12Q99LL3 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Chst12Q99LL3 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Chst12Q99LL3 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Chst12Q99LL3 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Chst12Q99LL3 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Chst12Q99LL3 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Chst12Q99LL3 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Chst12Q99LL3 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Chst12Q99LL3 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Chst12Q99LL3 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Chst12Q99LL3 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Chst12Q99LL3 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Chst12Q99LL3 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Chst12Q99LL3 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Chst12Q99LL3 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Chst12Q99LL3 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Chst12Q99LL3 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Chst12Q99LL3 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Chst12Q99LL3 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Chst12Q99LL3 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Chst12Q99LL3 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Chst12Q99LL3 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Chst12Q99LL3 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Chst12Q99LL3 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Chst12Q99LL3 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Chst12Q99LL3 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Chst12Q99LL3 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Chst12Q99LL3 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Chst12Q99LL3 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Chst12Q99LL3 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Chst12Q99LL3 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chst12Q99LL3 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms