Protein–RNA interactions for Protein: Q99LE6

Abcf2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf2Q99LE6 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Abcf2Q99LE6 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Abcf2Q99LE6 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Abcf2Q99LE6 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Abcf2Q99LE6 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Abcf2Q99LE6 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Abcf2Q99LE6 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Abcf2Q99LE6 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Abcf2Q99LE6 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Abcf2Q99LE6 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Abcf2Q99LE6 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Abcf2Q99LE6 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Abcf2Q99LE6 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Abcf2Q99LE6 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Abcf2Q99LE6 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Abcf2Q99LE6 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Abcf2Q99LE6 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Abcf2Q99LE6 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Abcf2Q99LE6 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Abcf2Q99LE6 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Abcf2Q99LE6 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Abcf2Q99LE6 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Abcf2Q99LE6 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Abcf2Q99LE6 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Abcf2Q99LE6 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Abcf2Q99LE6 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Abcf2Q99LE6 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Abcf2Q99LE6 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Abcf2Q99LE6 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Abcf2Q99LE6 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Abcf2Q99LE6 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Abcf2Q99LE6 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Abcf2Q99LE6 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Abcf2Q99LE6 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Abcf2Q99LE6 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Abcf2Q99LE6 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Abcf2Q99LE6 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Abcf2Q99LE6 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Abcf2Q99LE6 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Abcf2Q99LE6 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Abcf2Q99LE6 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Abcf2Q99LE6 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Abcf2Q99LE6 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Abcf2Q99LE6 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Abcf2Q99LE6 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Abcf2Q99LE6 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Abcf2Q99LE6 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Abcf2Q99LE6 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Abcf2Q99LE6 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Abcf2Q99LE6 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Abcf2Q99LE6 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Abcf2Q99LE6 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Abcf2Q99LE6 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Abcf2Q99LE6 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Abcf2Q99LE6 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Abcf2Q99LE6 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Abcf2Q99LE6 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Abcf2Q99LE6 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Abcf2Q99LE6 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Abcf2Q99LE6 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Abcf2Q99LE6 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Abcf2Q99LE6 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Abcf2Q99LE6 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Abcf2Q99LE6 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Abcf2Q99LE6 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Abcf2Q99LE6 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Abcf2Q99LE6 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Abcf2Q99LE6 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Abcf2Q99LE6 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Abcf2Q99LE6 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Abcf2Q99LE6 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Abcf2Q99LE6 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Abcf2Q99LE6 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Abcf2Q99LE6 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Abcf2Q99LE6 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Abcf2Q99LE6 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Abcf2Q99LE6 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Abcf2Q99LE6 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Abcf2Q99LE6 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Abcf2Q99LE6 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Abcf2Q99LE6 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Abcf2Q99LE6 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Abcf2Q99LE6 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Abcf2Q99LE6 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Abcf2Q99LE6 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Abcf2Q99LE6 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Abcf2Q99LE6 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Abcf2Q99LE6 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Abcf2Q99LE6 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Abcf2Q99LE6 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Abcf2Q99LE6 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Abcf2Q99LE6 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Abcf2Q99LE6 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Abcf2Q99LE6 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Abcf2Q99LE6 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Abcf2Q99LE6 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Abcf2Q99LE6 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Abcf2Q99LE6 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Abcf2Q99LE6 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Abcf2Q99LE6 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms