Protein–RNA interactions for Protein: Q99KW3

Triobp, TRIO and F-actin-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TriobpQ99KW3 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TriobpQ99KW3 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TriobpQ99KW3 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TriobpQ99KW3 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TriobpQ99KW3 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TriobpQ99KW3 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TriobpQ99KW3 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TriobpQ99KW3 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
TriobpQ99KW3 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TriobpQ99KW3 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
TriobpQ99KW3 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TriobpQ99KW3 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TriobpQ99KW3 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TriobpQ99KW3 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TriobpQ99KW3 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TriobpQ99KW3 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TriobpQ99KW3 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TriobpQ99KW3 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TriobpQ99KW3 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TriobpQ99KW3 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TriobpQ99KW3 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TriobpQ99KW3 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TriobpQ99KW3 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TriobpQ99KW3 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TriobpQ99KW3 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
TriobpQ99KW3 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
TriobpQ99KW3 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TriobpQ99KW3 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TriobpQ99KW3 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
TriobpQ99KW3 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TriobpQ99KW3 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TriobpQ99KW3 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TriobpQ99KW3 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TriobpQ99KW3 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TriobpQ99KW3 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TriobpQ99KW3 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TriobpQ99KW3 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TriobpQ99KW3 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TriobpQ99KW3 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TriobpQ99KW3 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TriobpQ99KW3 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TriobpQ99KW3 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TriobpQ99KW3 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TriobpQ99KW3 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TriobpQ99KW3 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TriobpQ99KW3 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TriobpQ99KW3 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
TriobpQ99KW3 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TriobpQ99KW3 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TriobpQ99KW3 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TriobpQ99KW3 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TriobpQ99KW3 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TriobpQ99KW3 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TriobpQ99KW3 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TriobpQ99KW3 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TriobpQ99KW3 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TriobpQ99KW3 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TriobpQ99KW3 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TriobpQ99KW3 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TriobpQ99KW3 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TriobpQ99KW3 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TriobpQ99KW3 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TriobpQ99KW3 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TriobpQ99KW3 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TriobpQ99KW3 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TriobpQ99KW3 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TriobpQ99KW3 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TriobpQ99KW3 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TriobpQ99KW3 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TriobpQ99KW3 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TriobpQ99KW3 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TriobpQ99KW3 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TriobpQ99KW3 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TriobpQ99KW3 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TriobpQ99KW3 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TriobpQ99KW3 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TriobpQ99KW3 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TriobpQ99KW3 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TriobpQ99KW3 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TriobpQ99KW3 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TriobpQ99KW3 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TriobpQ99KW3 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TriobpQ99KW3 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TriobpQ99KW3 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TriobpQ99KW3 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TriobpQ99KW3 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TriobpQ99KW3 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TriobpQ99KW3 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TriobpQ99KW3 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TriobpQ99KW3 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TriobpQ99KW3 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TriobpQ99KW3 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TriobpQ99KW3 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TriobpQ99KW3 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TriobpQ99KW3 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
TriobpQ99KW3 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
TriobpQ99KW3 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TriobpQ99KW3 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TriobpQ99KW3 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TriobpQ99KW3 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms