Protein–RNA interactions for Protein: Q99KR6

Rnf34, E3 ubiquitin-protein ligase RNF34, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf34Q99KR6 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rnf34Q99KR6 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rnf34Q99KR6 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rnf34Q99KR6 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rnf34Q99KR6 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rnf34Q99KR6 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rnf34Q99KR6 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rnf34Q99KR6 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Rnf34Q99KR6 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rnf34Q99KR6 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Rnf34Q99KR6 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Rnf34Q99KR6 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rnf34Q99KR6 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rnf34Q99KR6 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rnf34Q99KR6 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rnf34Q99KR6 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rnf34Q99KR6 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rnf34Q99KR6 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rnf34Q99KR6 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rnf34Q99KR6 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rnf34Q99KR6 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rnf34Q99KR6 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rnf34Q99KR6 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rnf34Q99KR6 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rnf34Q99KR6 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rnf34Q99KR6 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rnf34Q99KR6 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rnf34Q99KR6 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rnf34Q99KR6 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rnf34Q99KR6 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rnf34Q99KR6 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rnf34Q99KR6 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rnf34Q99KR6 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rnf34Q99KR6 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rnf34Q99KR6 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rnf34Q99KR6 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rnf34Q99KR6 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rnf34Q99KR6 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rnf34Q99KR6 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rnf34Q99KR6 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rnf34Q99KR6 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rnf34Q99KR6 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rnf34Q99KR6 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rnf34Q99KR6 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rnf34Q99KR6 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rnf34Q99KR6 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rnf34Q99KR6 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rnf34Q99KR6 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rnf34Q99KR6 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rnf34Q99KR6 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rnf34Q99KR6 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rnf34Q99KR6 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Rnf34Q99KR6 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rnf34Q99KR6 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rnf34Q99KR6 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rnf34Q99KR6 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rnf34Q99KR6 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rnf34Q99KR6 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rnf34Q99KR6 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rnf34Q99KR6 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rnf34Q99KR6 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rnf34Q99KR6 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rnf34Q99KR6 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rnf34Q99KR6 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnf34Q99KR6 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnf34Q99KR6 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnf34Q99KR6 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnf34Q99KR6 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnf34Q99KR6 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnf34Q99KR6 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnf34Q99KR6 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnf34Q99KR6 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnf34Q99KR6 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnf34Q99KR6 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnf34Q99KR6 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnf34Q99KR6 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnf34Q99KR6 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnf34Q99KR6 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnf34Q99KR6 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnf34Q99KR6 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnf34Q99KR6 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnf34Q99KR6 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rnf34Q99KR6 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rnf34Q99KR6 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rnf34Q99KR6 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rnf34Q99KR6 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rnf34Q99KR6 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rnf34Q99KR6 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rnf34Q99KR6 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rnf34Q99KR6 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rnf34Q99KR6 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rnf34Q99KR6 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rnf34Q99KR6 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rnf34Q99KR6 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rnf34Q99KR6 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnf34Q99KR6 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnf34Q99KR6 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnf34Q99KR6 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnf34Q99KR6 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnf34Q99KR6 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms