Protein–RNA interactions for Protein: Q99KR3

Lactb2, Endoribonuclease LACTB2, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lactb2Q99KR3 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lactb2Q99KR3 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lactb2Q99KR3 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lactb2Q99KR3 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lactb2Q99KR3 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lactb2Q99KR3 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lactb2Q99KR3 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lactb2Q99KR3 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lactb2Q99KR3 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lactb2Q99KR3 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lactb2Q99KR3 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lactb2Q99KR3 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lactb2Q99KR3 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lactb2Q99KR3 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lactb2Q99KR3 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lactb2Q99KR3 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lactb2Q99KR3 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lactb2Q99KR3 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lactb2Q99KR3 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lactb2Q99KR3 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lactb2Q99KR3 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lactb2Q99KR3 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lactb2Q99KR3 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lactb2Q99KR3 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Lactb2Q99KR3 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lactb2Q99KR3 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lactb2Q99KR3 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lactb2Q99KR3 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lactb2Q99KR3 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Lactb2Q99KR3 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lactb2Q99KR3 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lactb2Q99KR3 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lactb2Q99KR3 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lactb2Q99KR3 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lactb2Q99KR3 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lactb2Q99KR3 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lactb2Q99KR3 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Lactb2Q99KR3 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lactb2Q99KR3 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lactb2Q99KR3 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lactb2Q99KR3 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lactb2Q99KR3 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lactb2Q99KR3 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lactb2Q99KR3 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lactb2Q99KR3 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lactb2Q99KR3 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lactb2Q99KR3 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lactb2Q99KR3 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lactb2Q99KR3 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lactb2Q99KR3 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lactb2Q99KR3 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lactb2Q99KR3 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lactb2Q99KR3 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lactb2Q99KR3 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lactb2Q99KR3 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lactb2Q99KR3 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lactb2Q99KR3 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lactb2Q99KR3 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lactb2Q99KR3 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lactb2Q99KR3 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lactb2Q99KR3 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lactb2Q99KR3 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lactb2Q99KR3 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lactb2Q99KR3 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lactb2Q99KR3 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lactb2Q99KR3 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lactb2Q99KR3 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lactb2Q99KR3 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lactb2Q99KR3 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lactb2Q99KR3 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lactb2Q99KR3 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lactb2Q99KR3 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lactb2Q99KR3 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lactb2Q99KR3 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Lactb2Q99KR3 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lactb2Q99KR3 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lactb2Q99KR3 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lactb2Q99KR3 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lactb2Q99KR3 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lactb2Q99KR3 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lactb2Q99KR3 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lactb2Q99KR3 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lactb2Q99KR3 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lactb2Q99KR3 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lactb2Q99KR3 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lactb2Q99KR3 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lactb2Q99KR3 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lactb2Q99KR3 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lactb2Q99KR3 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lactb2Q99KR3 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lactb2Q99KR3 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lactb2Q99KR3 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Lactb2Q99KR3 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lactb2Q99KR3 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lactb2Q99KR3 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lactb2Q99KR3 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lactb2Q99KR3 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lactb2Q99KR3 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lactb2Q99KR3 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lactb2Q99KR3 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms