Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN2

Ciao1, Probable cytosolic iron-sulfur protein assembly protein CIAO1, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ciao1Q99KN2 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ciao1Q99KN2 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ciao1Q99KN2 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Ciao1Q99KN2 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ciao1Q99KN2 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Ciao1Q99KN2 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ciao1Q99KN2 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Ciao1Q99KN2 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ciao1Q99KN2 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ciao1Q99KN2 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ciao1Q99KN2 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ciao1Q99KN2 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ciao1Q99KN2 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ciao1Q99KN2 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ciao1Q99KN2 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ciao1Q99KN2 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ciao1Q99KN2 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ciao1Q99KN2 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ciao1Q99KN2 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ciao1Q99KN2 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ciao1Q99KN2 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ciao1Q99KN2 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ciao1Q99KN2 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ciao1Q99KN2 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ciao1Q99KN2 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ciao1Q99KN2 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ciao1Q99KN2 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ciao1Q99KN2 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ciao1Q99KN2 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ciao1Q99KN2 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ciao1Q99KN2 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ciao1Q99KN2 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ciao1Q99KN2 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Ciao1Q99KN2 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ciao1Q99KN2 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ciao1Q99KN2 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ciao1Q99KN2 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ciao1Q99KN2 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ciao1Q99KN2 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ciao1Q99KN2 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Ciao1Q99KN2 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Ciao1Q99KN2 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ciao1Q99KN2 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ciao1Q99KN2 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ciao1Q99KN2 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ciao1Q99KN2 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
Ciao1Q99KN2 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ciao1Q99KN2 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ciao1Q99KN2 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ciao1Q99KN2 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ciao1Q99KN2 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ciao1Q99KN2 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ciao1Q99KN2 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ciao1Q99KN2 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ciao1Q99KN2 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ciao1Q99KN2 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Ciao1Q99KN2 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ciao1Q99KN2 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ciao1Q99KN2 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ciao1Q99KN2 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ciao1Q99KN2 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ciao1Q99KN2 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ciao1Q99KN2 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ciao1Q99KN2 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ciao1Q99KN2 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ciao1Q99KN2 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ciao1Q99KN2 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ciao1Q99KN2 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ciao1Q99KN2 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ciao1Q99KN2 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ciao1Q99KN2 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ciao1Q99KN2 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ciao1Q99KN2 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ciao1Q99KN2 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ciao1Q99KN2 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ciao1Q99KN2 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ciao1Q99KN2 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ciao1Q99KN2 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ciao1Q99KN2 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ciao1Q99KN2 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ciao1Q99KN2 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ciao1Q99KN2 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ciao1Q99KN2 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ciao1Q99KN2 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ciao1Q99KN2 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ciao1Q99KN2 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ciao1Q99KN2 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Ciao1Q99KN2 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Ciao1Q99KN2 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ciao1Q99KN2 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Ciao1Q99KN2 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ciao1Q99KN2 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ciao1Q99KN2 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ciao1Q99KN2 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ciao1Q99KN2 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ciao1Q99KN2 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ciao1Q99KN2 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ciao1Q99KN2 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ciao1Q99KN2 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Ciao1Q99KN2 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
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