Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY4

Trabd, TraB domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrabdQ99JY4 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TrabdQ99JY4 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TrabdQ99JY4 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TrabdQ99JY4 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TrabdQ99JY4 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TrabdQ99JY4 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TrabdQ99JY4 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TrabdQ99JY4 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TrabdQ99JY4 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TrabdQ99JY4 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TrabdQ99JY4 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TrabdQ99JY4 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TrabdQ99JY4 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TrabdQ99JY4 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TrabdQ99JY4 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TrabdQ99JY4 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TrabdQ99JY4 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TrabdQ99JY4 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TrabdQ99JY4 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TrabdQ99JY4 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TrabdQ99JY4 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TrabdQ99JY4 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TrabdQ99JY4 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TrabdQ99JY4 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TrabdQ99JY4 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TrabdQ99JY4 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TrabdQ99JY4 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TrabdQ99JY4 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TrabdQ99JY4 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TrabdQ99JY4 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TrabdQ99JY4 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TrabdQ99JY4 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TrabdQ99JY4 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TrabdQ99JY4 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TrabdQ99JY4 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TrabdQ99JY4 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TrabdQ99JY4 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TrabdQ99JY4 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TrabdQ99JY4 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TrabdQ99JY4 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TrabdQ99JY4 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TrabdQ99JY4 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TrabdQ99JY4 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TrabdQ99JY4 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TrabdQ99JY4 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TrabdQ99JY4 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TrabdQ99JY4 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TrabdQ99JY4 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TrabdQ99JY4 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TrabdQ99JY4 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TrabdQ99JY4 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TrabdQ99JY4 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TrabdQ99JY4 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TrabdQ99JY4 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TrabdQ99JY4 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TrabdQ99JY4 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TrabdQ99JY4 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TrabdQ99JY4 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TrabdQ99JY4 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TrabdQ99JY4 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TrabdQ99JY4 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TrabdQ99JY4 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TrabdQ99JY4 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TrabdQ99JY4 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
TrabdQ99JY4 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TrabdQ99JY4 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TrabdQ99JY4 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TrabdQ99JY4 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
TrabdQ99JY4 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TrabdQ99JY4 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TrabdQ99JY4 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TrabdQ99JY4 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TrabdQ99JY4 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TrabdQ99JY4 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TrabdQ99JY4 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TrabdQ99JY4 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
TrabdQ99JY4 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TrabdQ99JY4 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TrabdQ99JY4 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TrabdQ99JY4 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TrabdQ99JY4 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TrabdQ99JY4 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TrabdQ99JY4 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TrabdQ99JY4 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TrabdQ99JY4 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TrabdQ99JY4 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TrabdQ99JY4 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TrabdQ99JY4 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TrabdQ99JY4 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TrabdQ99JY4 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TrabdQ99JY4 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TrabdQ99JY4 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TrabdQ99JY4 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TrabdQ99JY4 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TrabdQ99JY4 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TrabdQ99JY4 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TrabdQ99JY4 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TrabdQ99JY4 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TrabdQ99JY4 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TrabdQ99JY4 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms