Protein–RNA interactions for Protein: Q925Q3

Slc8b1, Mitochondrial sodium/calcium exchanger protein, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc8b1Q925Q3 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc8b1Q925Q3 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc8b1Q925Q3 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc8b1Q925Q3 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc8b1Q925Q3 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc8b1Q925Q3 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc8b1Q925Q3 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc8b1Q925Q3 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc8b1Q925Q3 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc8b1Q925Q3 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc8b1Q925Q3 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc8b1Q925Q3 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc8b1Q925Q3 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc8b1Q925Q3 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc8b1Q925Q3 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc8b1Q925Q3 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc8b1Q925Q3 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc8b1Q925Q3 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc8b1Q925Q3 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc8b1Q925Q3 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc8b1Q925Q3 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc8b1Q925Q3 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc8b1Q925Q3 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc8b1Q925Q3 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc8b1Q925Q3 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc8b1Q925Q3 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc8b1Q925Q3 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc8b1Q925Q3 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc8b1Q925Q3 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc8b1Q925Q3 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc8b1Q925Q3 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc8b1Q925Q3 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc8b1Q925Q3 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc8b1Q925Q3 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc8b1Q925Q3 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc8b1Q925Q3 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc8b1Q925Q3 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc8b1Q925Q3 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc8b1Q925Q3 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc8b1Q925Q3 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc8b1Q925Q3 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc8b1Q925Q3 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc8b1Q925Q3 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc8b1Q925Q3 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc8b1Q925Q3 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc8b1Q925Q3 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc8b1Q925Q3 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc8b1Q925Q3 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc8b1Q925Q3 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc8b1Q925Q3 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc8b1Q925Q3 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc8b1Q925Q3 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc8b1Q925Q3 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc8b1Q925Q3 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc8b1Q925Q3 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc8b1Q925Q3 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc8b1Q925Q3 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc8b1Q925Q3 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc8b1Q925Q3 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc8b1Q925Q3 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc8b1Q925Q3 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Slc8b1Q925Q3 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Slc8b1Q925Q3 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Slc8b1Q925Q3 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Slc8b1Q925Q3 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Slc8b1Q925Q3 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Slc8b1Q925Q3 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Slc8b1Q925Q3 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Slc8b1Q925Q3 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc8b1Q925Q3 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc8b1Q925Q3 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc8b1Q925Q3 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc8b1Q925Q3 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc8b1Q925Q3 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc8b1Q925Q3 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc8b1Q925Q3 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc8b1Q925Q3 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc8b1Q925Q3 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc8b1Q925Q3 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc8b1Q925Q3 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc8b1Q925Q3 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc8b1Q925Q3 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc8b1Q925Q3 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc8b1Q925Q3 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc8b1Q925Q3 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc8b1Q925Q3 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc8b1Q925Q3 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc8b1Q925Q3 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc8b1Q925Q3 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc8b1Q925Q3 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc8b1Q925Q3 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc8b1Q925Q3 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc8b1Q925Q3 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc8b1Q925Q3 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc8b1Q925Q3 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc8b1Q925Q3 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc8b1Q925Q3 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc8b1Q925Q3 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc8b1Q925Q3 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc8b1Q925Q3 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms